GENSCAN 1.0	Date run: 17-Jan-104	Time: 05:23:47

Sequence PLS3_1 : 91881 bp : 39.00% C+G : Isochore 1 ( 0 - 43 C+G%)

Parameter matrix: HumanIso.smat

Predicted genes/exons:

Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr..
----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------

 1.04 PlyA -    873    868    6                               1.05
 1.03 Term -   1324   1037  288  1  0   51   48   200 0.453   6.69
 1.02 Intr -   2103   1995  109  2  1   92   79     3 0.462  -0.83
 1.01 Init -   2512   2196  317  1  2   59   31   274 0.628  15.75
 1.00 Prom -  35685  35646   40                              -4.95

 2.01 Init +  50264  50327   64  1  1   69   97    95 0.924   9.86
ttgttttctttattaaagctgtatgtagagacatggtaacctattcagattgttttgata
gtttgaaattctgtttaaattatccctaagatgagaacttagcaagagtgcttatattta
tcacaattttttaaagtctgaaacgtttttggtttttctttagatctttaaatggatgag
ATGGCTACCACTCAGATTTCCAAAGATGAGCTTGATGAACTCAAAGAGGCCTTTGCAAAA
GTTG
gtgagtattttttgtagtaaaactatagggaagcaatatttatttggtctcaaagttatt
tctctataaatatcacatgaatggttaatcaaaaacattagggcaagatagttaaaatag
atgggataaagttttggaagctatacttaaaattgttttatttcttttttttttttttgg

 2.02 Intr +  62250  62413  164  1  2   61   92   164 0.997  12.87
taaaaccttgctttttccatttaaatgtccatttccctttcaaacaactttatgttcccc
acaataagaaaatattttatgtaagtgagcttatgaactgaacctcaaatgaagggaaat
actctaacttctgtctttcaattttttttccttttttgcttgctctccttttttacaaag
ATCTCAACAGCAACGGATTCATTTGTGACTATGAACTTCATGAGCTCTTCAAGGAAGCTA
ATATGCCATTACCAGGATATAAAGTGAGAGAAATTATTCAGAAACTCATGCTGGATGGTG
ACAGGAATAAAGATGGGAAAATAAGTTTTGACGAATTTGTTTAT
gtaagtatgtgaaaattcacaattattagaagtagtagatgttccctcgtctagtgggat
gttatagtattaagtactgttatgttaagttcttaaatatatcatattagtactgttata
acatttctgtcatcctgcccactaaatgtacttcttttagctgctggaatatcttaacaa

 2.03 Intr +  69202  69331  130  0  1   26   89   141 0.994   7.35
tttcagaaggggtattgtagtacttgtttagcatttcaaaaactcaagcccagttttttg
tatcttttaacatcagctatggaaaaaatgtaagtgatcaagatataaaagaatataaat
atgcttattgtgcatagtttgaaattaattgtgaatcaacaaaattactttaattaatag
ATTTTTCAAGAGGTAAAAAGTAGTGATATTGCCAAGACCTTCCGCAAAGCAATCAACAGG
AAAGAAGGTATTTGTGCTCTGGGTGGAACTTCAGAGTTGTCCAGCGAAGGAACACAGCAT
TCTTACTCAG
gtaatcattttatatgcaataggttaacacaatgtgctaagtgggatggttgctgtaatg
tcaaggacgggctctagaaaaacattaccttctaattaagaatacagtagaagtcctttg
tgacatgtatttaggcttgagactaatacttgtcataaaggcattataagtgtttattgt

 2.04 Intr +  69839  69971  133  0  1   27   91   122 0.984   5.18
attttgtaattcctaataaccactgtgttgcatccaagtgtctgggtttccacacagaat
aaccacatgtttctgacacattaactttcagcactactgcacaactattttaggctttgg
agtcaaatatttaataagttagagtatgaactaatgtcttgttatttaacataattttag
AGGAAGAAAAATATGCTTTTGTTAACTGGATAAACAAAGCTTTGGAAAATGATCCTGATT
GTAGACATGTTATACCAATGAACCCTAACACCGATGACCTGTTCAAAGCTGTTGGTGATG
GAATTGTGCTTTG
gtaagatgttagcttgttttatatccagatatccaaaaatagccttccatataattgata
tatttgtttctgcatgcttgacaggttcacctcaagaaataactagaatggaaaattatc
caggttctgcctttttcatttaatctctaggtctgtccatgaatctaaaattcagccata

 2.05 Intr +  74004  74085   82  0  1   68   85   104 0.669   6.82
tttccatatgtgtagtttattatgatcaacatgataaaagtcatctagctgcatttttta
gagtacatgaaagagatgttatagtaagctttaaaatatttgtaaatatttacagccact
ttataaaaggaaatcagctctttttttttacatcagcctttttttaaatttttgtttcag
TAAAATGATTAACCTTTCAGTTCCTGATACCATTGATGAAAGAGCAATCAACAAGAAGAA
ACTTACACCCTTCATCATTCAG
gtatgcattgttctcccctccctttaacatgaaattactgtttgaggacctgttctgcag
acttcagcctctgcactctgtaggctcccaatcaatccttgtaaaaactgttgagtgtgg
gattgttatccagattatacagacagaactgggactcagaaaggtttctgagcttgcctg

 2.06 Intr +  74885  75050  166  1  1   49   90    89 0.965   3.81
tgtcttagctaggctttctaacacaaaactctggaatttgttttttgtgacacatatatg
gatgaaattaatacagggtattaatttcctcattgaatgttattttcagtgaagggagaa
agtagactgctaaaaaatggaaaggtcaagaagcaagtgtgtaatttggctgtcttgcag
GAAAACTTGAACTTGGCACTGAACTCTGCTTCTGCCATTGGGTGTCATGTTGTGAACATT
GGTGCAGAAGATTTGAGGGCTGGGAAACCTCATCTGGTTTTGGGACTGCTTTGGCAGATC
ATTAAGATCGGTTTGTTCGCTGACATTGAATTAAGCAGGAATGAAG
gtaatggaacacagtcattctggcagttgtttattggttatttttttctagtcatgcaga
ctttcgtgctctcacttaatggaggtgattaaatggtggtaactagaatgaacataaggt
aatgctatagagttattcaggaaaatagcctaattacatgactctcttctttactagtaa

 2.07 Intr +  76840  76982  143  2  2  103   88    58 0.998   6.45
gttattatatctgttatatatttatcttttttagtagattatgagtatcttgaaactagg
aactatgtcatagtagtttttgcacctctattacttaacagtgtcaaaagactgaatgaa
cttggcatgaccattattgtgtcatataataactgtgggatttttttttttttcttctag
CCTTGGCTGCTTTACTCCGAGATGGTGAGACTTTGGAGGAACTTATGAAATTGTCTCCAG
AAGAGCTTCTGCTTAGATGGGCAAACTTTCATTTGGAAAACTCGGGCTGGCAAAAAATTA
ACAACTTTAGTGCTGACATCAAG
gtaactgttgaaagaatcacaacattttggggggatataatagctggaagatttcatccc
agcttaacagagagaaaatcctaacactgtatcaccaagccttgttgtctcttggccctg
aaggtagattttagaagagtaatagagccagataaggtacattagcacctatgttttatt

 2.08 Intr +  80412  80507   96  2  0   94  101    42 0.977   5.39
agacagatataaggcagatagatggacttttctggggaaaacacctgttaaattaaaagg
cagagatttgtgccatttattctcaaaaaatccaatgcaaatagccttccaaacatggga
caataggatacattcattccttgtaactgtgatctcactgacattttcaattctttgtag
GATTCCAAAGCCTATTTCCATCTTCTCAATCAAATCGCACCAAAAGGACAAAAGGAAGGT
GAACCACGGATAGATATTAACATGTCAGGTTTCAAT
gtaagtataagtgctcttttgaattctacaatcttgcaaaattattgtcaatttcttata
agtacaataatttttataatcgtatgaagtagagttggcaattttaagcattattttaaa
atgtattactgtacatgtaattcagaggccagaaaactagctttgatttattttgattgt

 2.09 Intr +  83317  83512  196  0  1   79   88   145 0.999  11.67
ttacaggtactgcatctccaagagggccaacctttttttttgcattcaaaacaattttat
aataagtaccatatgttagctaaaagaaagtagaactgtatacccagactatgacagtgg
ggaaattttctatatttttagtgtggcctttgacaaagtcttccgattttgtttcaacag
GAAACAGATGATTTGAAGAGAGCTGAGAGTATGCTTCAACAAGCAGATAAATTAGGTTGC
AGACAGTTTGTTACCCCTGCTGATGTTGTCAGTGGAAACCCCAAACTCAACTTAGCTTTC
GTGGCTAACCTGTTTAATAAATACCCAGCACTAACTAAGCCAGAGAACCAGGATATTGAC
TGGACTCTATTAGAAG
gtaactaaaaacctcaatttcgaatgtgtgggactatagagtagaaatacataggccaca
atgattttacaatctagacttaataagtttttttatatctacaagaagtagatggcagat
gctgagtaaaaactggcaggaaagtacgatacaagtgaacttttaaagtaaagtagtcga

 2.10 Intr +  85033  85111   79  2  1   58   59    70 0.891  -1.21
taaaaataagcctgtacctagagagaatgtatgtacttagaagaatgcttggaaactcgt
attatcgaaaaattctagatctgaatagagagataaaataatctaatatgtgtattggca
ctatatgcacatacataaagtgtttaatgaatcagtaaattttgtgaatattcttaacag
GAGAAACTCGTGAAGAAAGAACCTTCCGTAACTGGATGAACTCTCTTGGTGTCAATCCTC
ACGTAAACCATCTCTATGC
gtaagccttcctactgctattgtaaacagttacgaatgtcatgaatggatgttaaataat
gacagctctaaagattttctagatattaatttgtagctattatttatattggaaaatgtc
aagtggtgatttccatcatcattttccaaatacacaaaagctttaagtattcctttacat

 2.11 Intr +  86084  86198  115  2  1   46   71   148 0.892   8.43
acttataaatgaatgggatggtcttagctctgttttcagcacagattgatagaaaatatg
agtcttgggtattatttatggttttatatatcttgtttgacaatgtagtgttactgtttt
taaggaaagtcaagtcccagcttcctgaaaacactgattacattatttttaaatcattag
TGACCTGCAAGATGCCCTGGTAATCTTACAGTTATATGAACGAATTAAAGTTCCTGTTGA
CTGGAGTAAGGTTAATAAACCTCCATACCCGAAACTGGGAGCCAACATGAAAAAG
gtagataattaagttgctgtatatatttgttagagtatttttattctcgattaatttctt
ttgtttctaaaactcttgacgctgagcttcttgaggacaaaactgtgtcttatttgtttt
tgtgtgctgatacctagcattatacaagacacacacacacgtatgcagattaaacaaatg

 2.12 Intr +  86414  86547  134  1  2   95   75   134 0.999  11.32
tatttttattctcgattaatttcttttgtttctaaaactcttgacgctgagcttcttgag
gacaaaactgtgtcttatttgtttttgtgtgctgatacctagcattatacaagacacaca
cacacgtatgcagattaaacaaatggaagtctttaaccatttactcttgtgcctttgcag
CTAGAAAACTGCAACTATGCTGTTGAATTAGGGAAGCATCCTGCTAAATTCTCCCTGGTT
GGCATTGGAGGGCAAGACCTGAATGATGGGAACCAAACCCTGACTTTAGCTTTAGTCTGG
CAGCTGATGAGAAG
gtatagtacacaattttagctgtttagtctttactatcatacaggtctgtgatttagtcc
ttactgtgtttaataagtggatatgtcgataactacacttttgaaatatgttatatttac
actccgaaatgagtttaattaatgaatatatgttggatgttaagtgggagatgcttcctt

 2.13 Intr +  87562  87685  124  1  1   77   77   157 0.999  13.17
ttgcagtgagcaggagattgcgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccg
tctcaaaaaaaagaagaaaaatttaagaaatataaaaagtggaagataaagcatctttct
gatgtttgcatttttcctcataaagtagatggtgacgttttcttctgctgcctctcttag
ATATACCCTCAATGTCCTGGAAGATCTTGGAGATGGTCAGAAAGCCAATGACGACATCAT
TGTGAACTGGGTGAACAGAACGTTGAGTGAAGCTGGAAAATCAACTTCCATTCAGAGTTT
TAAG
gtcagaatccatatttgactattaaatattatgtttgctggataacatctatcatttggg
aaggcaacttttggcttctttgtgagtgagaattagtgttgggctaatggcacaattctt
tacgaattcactgggctttgtttttggcacttgatataagtaagcacatgttaatttgta

 2.14 Intr +  87905  88029  125  1  2   68   80   129 0.670   8.56
ggataacatctatcatttgggaaggcaacttttggcttctttgtgagtgagaattagtgt
tgggctaatggcacaattctttacgaattcactgggctttgtttttggcacttgatataa
gtaagcacatgttaatttgtatgtatcaaaattctcagatttgttctcctttcacactag
GACAAGACGATCAGCTCCAGTTTGGCAGTTGTGGATTTAATTGATGCCATCCAGCCAGGC
TGTATAAACTATGACCTTGTGAAGAGTGGCAATCTAACAGAAGATGACAAGCACAATAAT
GCCAA
gtaagggagactgctaatagtatgaaaagaacgcagctttgtagctggacagatctgaat
tctaattcaggttctgccatttaagagtggtgtcaccttgggagaaacctcttggagcct
cagattcctcatcaataaactgggggcaataatacttaccttagattttataaagattaa

 2.15 Term +  89441  89573  133  2  1   73   38    88 0.637  -1.12
ttcaaagtgaaatcaaaacccaaatcaaaagaaaacaaaaagcaaaactgttctaattgg
aactatcaatatggaatttttgcatcccagcataataattatatatgaggaaatagatgt
cttacgtggtgtccttaactgacaagaatttcatcctgattttgtttccccctaaaatag
GTATGCAGTGTCAATGGCTAGAAGAATCGGAGCCAGAGTGTATGCTCTCCCTGAAGACCT
TGTGGAAGTAAAGCCCAAGATGGTCATGACTGTGTTTGCATGTTTGATGGGCAGGGGAAT
GAAGAGAGTGTAA
aataaccaatctgaataaaacagccatgctcccaggtgcatgattcgcaggtcagctatt
tccaggtgaagtgcttatggcttaaggaactcttggccattcaaaggacttttcattttg
attaacaggactagcttatcatgagagccctcaggggaaagggtttaagaaaaacaactc

 3.02 PlyA -  90115  90110    6                               1.05
 3.01 Term -  91757  91598  160  1  1   69   48   117 0.541   2.23

Predicted peptide sequence(s):


>PLS3_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|237_aa
MARLSNPLSSKLNLLQKFNLLHHWGYRAAQVRGKEHRIRLESDAINPHSTSRAGIILRPG
ARRSEPPAHWSSDGGSNFGTGEKPGRGWSASPGLSLQRLSTAGGEKVGRGPGLPPPRPRA
RGRKVKGAEKRTGGVGPGENGKETRSPSARRRLQSTYVKSQSPGSGPTAADQRTQTTSAP
RNLCSCGSKASAPSPPASPLRPSAAAIGSGGASSRPGNQEGDWATSLSHQLGGDPGK

>PLS3_1|GENSCAN_predicted_peptide_2|627_aa
MATTQISKDELDELKEAFAKVDLNSNGFICDYELHELFKEANMPLPGYKVREIIQKLMLD
GDRNKDGKISFDEFVYIFQEVKSSDIAKTFRKAINRKEGICALGGTSELSSEGTQHSYSE
EEKYAFVNWINKALENDPDCRHVIPMNPNTDDLFKAVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERAI
NKKKLTPFIIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLRAGKPHLVLGLLWQIIKIGLFADI
ELSRNEALAALLRDGETLEELMKLSPEELLLRWANFHLENSGWQKINNFSADIKDSKAYF
HLLNQIAPKGQKEGEPRIDINMSGFNETDDLKRAESMLQQADKLGCRQFVTPADVVSGNP
KLNLAFVANLFNKYPALTKPENQDIDWTLLEGETREERTFRNWMNSLGVNPHVNHLYADL
QDALVILQLYERIKVPVDWSKVNKPPYPKLGANMKKLENCNYAVELGKHPAKFSLVGIGG
QDLNDGNQTLTLALVWQLMRRYTLNVLEDLGDGQKANDDIIVNWVNRTLSEAGKSTSIQS
FKDKTISSSLAVVDLIDAIQPGCINYDLVKSGNLTEDDKHNNAKYAVSMARRIGARVYAL
PEDLVEVKPKMVMTVFACLMGRGMKRV

>PLS3_1|GENSCAN_predicted_peptide_3|53_aa
XLWALYSEPPKKSAPFLKKGPHVIYLSYLVKEALQGVRAYREEPLYFDEDERE