GENSCAN 1.0 Date run: 17-Jan-104 Time: 04:37:32 Sequence PIGA_1 : 18465 bp : 39.92% C+G : Isochore 1 ( 0 - 43 C+G%) Parameter matrix: HumanIso.smat Predicted genes/exons: Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr.. ----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------ 1.01 Intr + 846 970 125 2 2 25 84 109 0.533 2.66 aacaggatgtctagttaaatttacatgtccgataaaaaacgaatgtgtagtgaagtcccc aatatttggtacatgcttgtattaaacatcatttgtgctttatctgaaattaaaacttca tagtttcatctgttttgactttttgtgtatttttatttatttatctggcaaacgtcccag AGCGGTAAGAACCGGCACGGTTTTGCCGTGGCACAGCTGATTACAAACAAAAAGTCTCTC CAATCAGAAGCAAGCGCGCAGAGAACTGGCGTCCGGAATAGAGACGCTGTAACCAGGAAA CCAGG gtgagcacccaccctaccgtcggccgcttctaggagacgggcgcaggcgcgcgctgacgt tacatctcgcgcttaagggtggggacgacagagcgtctctctcggacgtgacctcagcgc ctctttgtgattggctgcctcgggggcgcggcccttgggcgcggacgccctagattggtg 1.02 Intr + 1254 1369 116 0 2 60 39 126 0.575 4.07 ggacgtgacctcagcgcctctttgtgattggctgcctcgggggcgcggcccttgggcgcg gacgccctagattggtgctgcggaacagcagggagggactccggctgcagccgcgggagg tccggacactggcggccatggaactcaccggtgagtgcgcgtcgcgccgcccctctccag CGCTCTGGGCCGCTTTCGGATGGGGCTGTTCTGCGCGCGTGGGATCGTGGCGGGTGGTGG AGGGGGTGAAACCGACCCGGTTCGAAGCCCGGAAGTTGGGTCGGAGGGTCTCCAGA gtaggttggggctgagggtgcgtttagggcggacgcgctgggttccttggctcaggcggg tgggtcgagggactggggtctccggaaccccgggcctgagaccaacgtccactctttggt tgttttctttctctctttgggcctggccatccccgccatgaacccagcggggtcgctgtc 1.03 Term + 1693 1883 191 2 2 26 48 114 0.386 -2.17 tggccatccccgccatgaacccagcggggtcgctgtctgagcaggggtatcccctccttg gcccgagcgtttccccagcgacctctcagggaatcagggaatgaagctcagacagtgccc aggaattgtcggtggaagtaccattctcttgacccacaactcctgccaggtctccctaag GTTCTTCAGGAACCTCTACTGCTAATGATTGCCCAGGGCTCGTTGGTCGTGGTCGAGAAT TTTACGGTAATGTCTTTGCCACTTTAAGTGGCTGGGTGGGAACCTTGGACAAATCACTCA ACTTGTCTGGGTTCTCATTTGTAAAACGAGAGAGGTATTCACTAGAGCTCCAAGCCTCAT TTCGGCTTTAA gagctaagattctgcgattgtgcagcataatgaacttttatgtcaaagatgtttggactg aaaacctggcggaagtgggcagactcctcacagaacgttgcaggctaatgacaacatttt aaatgatatcatttggttcattactcactgtttttgctatcgttcatcttttaaaactgg 2.01 Init + 4794 5508 715 2 1 91 90 473 0.657 42.08 tttaattctggggaaagctaacaaatttacattaacattaaaacaatatctatatctgga tttgtaatatggaatgtgttttgtttctgagctgagatcctgttttactctttttcaggt aatagaggacacatctcttaactgggttgctctaagaactgatgtctaaaccgtctcagc ATGGCCTGTAGAGGAGGAGCTGGGAATGGCCACCGTGCCTCAGCTACACTCTCTCGGGTT AGCCCTGGAAGTCTTTACACATGTAGAACCCGTACCCATAATATATGCATGGTATCTGAC TTTTTCTACCCAAATATGGGAGGCGTGGAAAGCCACATTTACCAGCTCTCTCAGTGCCTG ATTGAAAGAGGGCATAAGGTTATAATTGTCACCCATGCTTATGGAAATCGAAAAGGCATC CGTTACCTCACCAGTGGCCTCAAAGTCTATTACTTGCCTCTGAAAGTCATGTACAACCAG TCTACAGCCACGACCCTCTTTCACAGTCTGCCATTGCTCAGGTACATATTTGTTCGGGAG AGAGTCACGATAATCCATTCACATAGTTCTTTTTCTGCTATGGCCCATGATGCTCTCTTC CACGCCAAGACAATGGGGCTTCAGACAGTCTTCACGGACCATTCCCTTTTTGGATTTGCT GATGTCAGCTCGGTGCTTACAAACAAGCTTCTAACCGTGTCTCTTTGTGATACAAACCAC ATCATTTGTGTGTCTTATACTAGTAAGGAAAATACTGTACTAAGAGCAGCACTGAATCCT GAAATAGTGTCCGTCATTCCTAATGCTGTAGATCCTACTGACTTCACTCCAGACCCATTT AGAAGGCATGATAGTATAACTATTGTTGTTGTCAGCAGACTTGTTTACAGAAAAG gtaatgaaatgatagctataattgcattgtagacttttttccctatagaaagctgttgaa tacttgtatataatgattgtttggcttttcattttgttttatggttttataatgctataa attatagcaaagaaagttctaatattggtttatatatccaagaagagcgatttttcagga 2.02 Intr + 8411 8503 93 0 0 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gatataaatctaatgcaaggactgttttcaaaatttttatataaataggaaacctagtta 2.04 Intr + 11572 11704 133 1 1 34 98 89 0.998 4.23 aactgctttataaggctgtttctattagatcagtgtttggtgatactaatcttgaggtgg agaacattagcagcaataagaatttaagtgtaatataaatagcagacttggtttataaat taaatttcttttgtagcatgagttttcactcctttcttcccctctcatttaaaaaatcag GGTGCGTCTTTTGGGAGCTTTAGAACACAAGGATGTTAGAAATGTCTTAGTTCAAGGACA TATTTTTCTGAATACCTCCCTTACTGAAGCATTCTGCATGGCGATCGTGGAAGCAGCCAG TTGTGGTTTACAG gtaaaaagctttgagggcattcatggttgggatttctgtgtattttgaaaaataatgaga cacattccataataatgttttaactggttttgttgatcttcctgaggtatgattatggtg gagtatgtgttctttctttctttttaaggttgtaagtaccagagttggtggaattcctga 2.05 Intr + 11853 12059 207 2 0 88 95 96 0.995 8.65 cgatcgtggaagcagccagttgtggtttacaggtaaaaagctttgagggcattcatggtt gggatttctgtgtattttgaaaaataatgagacacattccataataatgttttaactggt tttgttgatcttcctgaggtatgattatggtggagtatgtgttctttctttctttttaag GTTGTAAGTACCAGAGTTGGTGGAATTCCTGAGGTGCTTCCAGAAAACCTTATTATTTTA TGTGAGCCTTCAGTAAAATCTTTGTGTGAAGGATTGGAAAAGGCTATTTTCCAACTGAAG TCAGGGACATTGCCAGCTCCAGAAAACATCCATAACATAGTAAAGACTTTCTACACCTGG AGGAATGTTGCAGAAAGAACTGAAAAG gtatgtcacatgctgagaaaagattgtgtctgaactcttacttgatgtttcacgtacaca tttgctttttcttacatagatgtttaccatttttgttctattgcttaagttgatgaaatc tcttccaggtgaaaagaaacagattttggtacacacaccgggctaagtgtctggtcaaat 2.06 Intr + 14498 14644 147 1 0 42 -33 179 0.523 0.71 actgaaatttcccccatctctttatcttcttttatttgaaatccatgaaatgcttctgca tgtcctcaccatccatgctcagcaacatgtacagcctcatgtggctgttgaaagaggagg ctctgtgttcccagaagtatgctagattgtagctctctgcttgtggttgatgtctgccag ATGCCGGTGAGAGCATCTCAGCTTAGTCAAGGAATCTTCAAAGGCAAATCCTGCTTCAGT ACTGCTGAAGTCACTGCTGAATTAAATATTGACCCTACAGTGGTGACCCCAAAAGCTGTT CAGACTTTGCGGGACTTTGGAATTCTA gtagttggctaaaattgatggtgactccctaggggagaggaactgtggcttattctttgt atcacacagcctctagcccggtgtcttgcccagaataagtacccaataagttttgaatca aatggcaataattatcgtgattaagttcattaaggatatcattactatgacaacaacaac 2.07 Intr + 14952 15214 263 2 2 118 75 225 0.127 19.56 ataattatcgtgattaagttcattaaggatatcattactatgacaacaacaacaaaacac aagcaacttttgtttgtatttgtttataaaatgttcctgcaggatcgggtcattgtttat catgggacaggtgatggggtgatgggtgaaagtgctcacacttggcttctctccctccag GTATATGACCGGGTATCAGTGGAAGCTGTGTTGCCAATGGACAAACGACTGGACAGACTT ATTTCTCACTGCGGCCCAGTAACAGGCTACATCTTTGCTTTGTTGGCAGTTTTCAACTTC CTCTTCCTCATTTTCTTGAGATGGATGACTCCAGATTCTATCATTGATGTTGCAATAGAT GCCACTGGGCCACGGGGTGCCTGGACTAATAACTATTCTCACAGTAAAAGAGGGGGTGAG AATAATGAGATATCTGAAACCAG gtagaaggaagcctagattgtaagattttaaacatttgtaatagttctataaagactatg gaaaataaccttgcttttggggggtttttgtttttttagagttaatttagtaagttatgc tacctctatatcattcaatattttctgttgaggaaagataaaaatgtatgcaattcctga Predicted peptide sequence(s): >PIGA_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|143_aa SGKNRHGFAVAQLITNKKSLQSEASAQRTGVRNRDAVTRKPGALGRFRMGLFCARGIVAG GGGGETDPVRSPEVGSEGLQSSSGTSTANDCPGLVGRGREFYGNVFATLSGWVGTLDKSL NLSGFSFVKRERYSLELQASFRL >PIGA_1|GENSCAN_predicted_peptide_2|564_aa MACRGGAGNGHRASATLSRVSPGSLYTCRTRTHNICMVSDFFYPNMGGVESHIYQLSQCL IERGHKVIIVTHAYGNRKGIRYLTSGLKVYYLPLKVMYNQSTATTLFHSLPLLRYIFVRE RVTIIHSHSSFSAMAHDALFHAKTMGLQTVFTDHSLFGFADVSSVLTNKLLTVSLCDTNH IICVSYTSKENTVLRAALNPEIVSVIPNAVDPTDFTPDPFRRHDSITIVVVSRLVYRKVD KACSWYNTSFDPPNNCRVDVIYMKLSLREGIDLLSGIIPELCQKYPDLNFIIGGEGPKRI ILEEVRERYQLHDRVRLLGALEHKDVRNVLVQGHIFLNTSLTEAFCMAIVEAASCGLQVV STRVGGIPEVLPENLIILCEPSVKSLCEGLEKAIFQLKSGTLPAPENIHNIVKTFYTWRN VAERTEKMPVRASQLSQGIFKGKSCFSTAEVTAELNIDPTVVTPKAVQTLRDFGILVYDR VSVEAVLPMDKRLDRLISHCGPVTGYIFALLAVFNFLFLIFLRWMTPDSIIDVAIDATGP RGAWTNNYSHSKRGGENNEISETX