GENSCAN 1.0	Date run: 16-Jan-104	Time: 23:30:06

Sequence POP1_1 : 42970 bp : 42.06% C+G : Isochore 1 ( 0 - 43 C+G%)

Parameter matrix: HumanIso.smat

Predicted genes/exons:

Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr..
----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------

 1.01 Intr +    480    751  272  1  2   69   77   170 0.008  10.34
tgttagctggggctccggcccggagtggccccaaccccgaatccccgaacccgcacgccc
tgggtccgacacagcttccaccagccacgttacctgtagggtccaatggcccctggggct
ttcgcggtgctgatcacccttctgatcaaggacgacatggctaagccttccctcttgcag
CCCCTTCAGGAGAAGAAGCCCCAGCACCAGCCCTGCTGGCTTCTTACTGGACTGACCAAC
CACAGCAGCGCCTCTGCCCCACAGCTCCCGCTGGGGGCGGGCTCGTGCGGCATTCTGGGA
ACTGTAGTTTCGGCGACGCTCCAGGCCACGTGGAGGAAGCGCCCGGTCTGGCGCATGCGC
TCTCCAGCGCGCTCTCCAGGAGCTTTGGCTCGGTGGGTACTGTCGCGGAGGCTTGTCATT
CTGACCCGGGGATTCCTCACAGCGTCTGGCAG
gttggtcgtgaggggctggtgccttccaggatgcgagtgtcgggggaactgtatgcggcg
gcccccctcccggcgcccgtctcccctcttcatcgtttctctctcagactccgctgacct
ctttccttgctgcctgtgcccggggcccctctccctggtgtcgcatctccttcggcccct

 1.02 Intr +   3342   3465  124  2  1   59  105    14 0.031  -0.56
tgagctcaagcaatcctcccgccttggcctcccaaagtgctgggattatagatgtgaacc
accacaccaggcctctggaaacttttaaattaaatcctcagacttcataaagatgcatcc
tatattcattcccttctgctgttagaggaccactgccagtttgatttcctcatattttag
TCTGGACCCAAAGCTCAGGGATGTTCCCAAGGTTATCCTAATCCTCCAGCACCAACCTTT
TCTTGGACCATTCTAATACTGAGGGGAGCTAGAGTTTCTATGGTGTTCTTGTCTAGCCTT
GCTG
gtgagttctgattcaagcaggtaacagtaggttaactaagttgttttgtaaaatatttgg
aatggcttttaatgcagaccgatctgaatcatgtgcttcactagccagccagttctgcag
aactccatttacttccttcatactgtttaatttgaaaaatgtttttgcatgtagatatag

 1.03 Intr +   6697   6840  144  2  0   99   93    94 0.486  10.33
tgtggtatcaacagttgtatatgatttaattatttgacagtgcaaactgcaatatactaa
tagggtctcttccatcaatagacttattttgaatcacatgaatatttactcattaaattt
atttttatttttgagtggaagtttcctttccctgtattaaatgtattacttcctttccag
AAATGTCAAATGCAAAAGAAAGAAAACACGCCAAGAAAATGAGAAACCAGCCTACCAATG
TGACTCTGTCCTCTGGCTTTGTGGCTGACAGAGGTGTAAAGCACCACAGTGGAGGTGAAA
AACCTTTCCAAGCTCAAAAACAAG
gtaaaatacacataagagaccaggcatggtggctcacgcctgtaatcccagcactttggg
aggctgaagtgggcggttcatgaggtcaagagatcaagaccatcctggccaacatggtga
aaccccgtctctactaaaaatacaagaattaactgggtgtggtggcgcgtgcctgtagtc

 1.04 Intr +  11726  11901  176  0  2   89   75   232 0.886  20.74
acactaccacaattaaaccctatattccttgtaccttgtacctataccttagatatgctt
tctggtctctctttacgccttcttggtggaggaattcagttaagtttccccagcagcctg
tttattctccagtgttaattcaagattggtgtttaatgactttgtcatctccttcaacag
CTTCTACTTTTGCTCAAGCACGAGCTGCTGAAATCAGTGCTATGTTAAAAGCTGTGACCC
AGAAGTCTTCGAATTCACTGGTTTTTCAGACTCTGCCACGGCACATGCGACGAAGAGCCA
TGAGCCACAACGTCAAACGCCTTCCCAGACGGTTACAGGAGATTGCCCAGAAAGAG
gtaggagttccacttagtgtaaatgtttagattagtagctcctagaagaaattgagaagt
attgacctaatagaatttattaaaaatgaaaaccaaggctgggcatggtggctcacgcct
gtaatctcagcactttgagaggctgaggtggtcagattgcttgagcccaggagttcaaga

 1.05 Intr +  13339  13587  249  0  0   28   99   239 0.999  15.71
ctctttccattgtcttccttctctacttacattgaagaaactaagttaacaatttaagca
aactaatgggatctataaaatattccacttaatctaaagttatttgtttgcattcctgac
cgttaactctgttttgagattcttacaaactgggatatgtccctctacttgaaactatag
GCGGAGAAAGCCGTACATCAGAAAAAAGAACATTCAAAAAATAAATGCCATAAAGCTCGA
AGATGTCACATGAACCGGACGCTAGAATTTAACCGTAGACAAAAGAAGAACATTTGGTTA
GAAACTCACATCTGGCACGCCAAGCGGTTTCATATGGTCAAGAAGTGGGGCTACTGCCTT
GGGGAGAGGCCAACAGTCAAGAGCCACAGAGCCTGCTATCGAGCCATGACGAACCGGTGC
CTCCTGCAG
gtgagcttttccagtgggctttttttgttatttttgtttgatccttttccatagaggcct
ttagaatagtttatgatgtgccaagccccgtttatgtgattattcattttaaaaataatt
cctgagcatgaagcccgggtcctttgccagatgctggagatcaggcagcctaaagttagg

 1.06 Intr +  17310  17397   88  2  1   97   97    86 0.999   9.02
attttttccactaaaccatcgggcaggagaaggtttagattttgacttatgagaacatag
ctttagcaatttgttttgtgtcttaggcctctaaaggttttgtgatacggcttttggctt
cttagcagttttgcctgtgtaaattcctaagtacttaattgtgtctcccgctttgtgcag
GATTTATCCTATTACTGTTGTTTGGAGTTGAAAGGCAAAGAGGAAGAAATACTAAAGGCG
CTTTCTGGAATGTGTAACATAGACACAG
gtaaacttgttttaaagctgagttctattttagtctatgtatatttattcatttcataaa
gaagtgtctactgtaagcattttggaattcaaacatatagaaaagtgtgtgagacactaa
tcattcccaatgaaaatgttaacttaaaaacagttgggttggcttttaaataatttctaa

 1.07 Intr +  17833  18020  188  2  2   22   75   176 0.841   8.19
tactcatttaacacatatttgttgagaacttattgtgtgccaggctttgatctgagcaat
cctcacaaccaaaacttcacctctcatggaggcagacagtaaatgacagtgtggttatca
ggaaataggactgcagtctcaacacccggaattatggaattttgcttttgttgatgtcag
GGCTGACGTTTGCAGCAGTTCACTGCTTGTCTGGAAAGCGCCAAGGGAGCCTTGTGCTTT
ATCGGGTGAATAAATATCCCAGAGAAATGCTTGGGCCTGTTACGTTTATCTGGAAGTCCC
AGAGGACCCCGGGTGACCCTTCTGAGAGCAGGCAGCTGTGGATCTGGCTGCATCCAACCC
TTAAACAG
gtataatccttcaggttatctcccgtcattctgaaactgcatttttaattactgctggaa
gtcaatactgtagaaatgtaaatagtgtaaaggtttgtctgatagtctgatatttgtata
tggggggctctatgattattgaatgaagtgaatttttaaaaaactttaaaaatttgtatt

 1.08 Intr +  19843  20099  257  0  2   53   80   198 0.999  10.82
ctgatctcaggtaatctacccacctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtatgagc
caccgtgcctggccaaaaatgttaatttttaaagagatttaaaaaaaaaaacccaactaa
atttgtcgtaatatatttaaatttcaagattttaaagtgaatgtttaaatatatttttag
GATATCTTAGAGGAAATAAAAGCAGCGTGCCAGTGTGTGGAACCCATCAAATCAGCTGTC
TGCATCGCTGACCCACTTCCAACACCATCCCAAGAAAAAAGCCAAACTGAATTGCCTGAC
GAGAAAATTGGCAAGAAAAGAAAAAGGAAAGATGATGGAGAAAATGCTAAACCAATTAAA
AAAATTATCGGTGATGGAACTAGAGATCCATGTCTACCATACTCTTGGATCTCTCCAACC
ACAGGCATTATAATCAG
gtatgagttgaatttgctttgaacctactgaacattttcagtgaagacctgctccatttt
tgtcagtggcacagatgttgtgtgatgaaagtttccattttaagatgttctttctttttc
agcgatttgacgatggagatgaacagattccggctgattgggccactttcccactccatc

 1.09 Intr +  20222  20315   94  2  1   90   56    84 0.918   4.45
ctagagatccatgtctaccatactcttggatctctccaaccacaggcattataatcaggt
atgagttgaatttgctttgaacctactgaacattttcagtgaagacctgctccatttttg
tcagtggcacagatgttgtgtgatgaaagtttccattttaagatgttctttctttttcag
CGATTTGACGATGGAGATGAACAGATTCCGGCTGATTGGGCCACTTTCCCACTCCATCCT
AACTGAAGCAATAAAAGCTGCTTCTGTCCACACT
gtaagagtaaaagtgactgtagtgttttattctaatcatgtttttcctgtcaaatttgtg
aaacctaatatataatttggtaacattttgggccatggcttttagatgtttatttcccta
cttattatgcttattatcaaagattttgttatctttcacttctcctagaagaccacaact

 1.10 Intr +  23439  23550  112  2  1   66   59   111 0.996   5.03
ggtagttagtctggtattaattactatgttaagtatagtggcaacttccctggttcatcc
cataacacatacatttccacacatagaagaagaaagagtgggggctgatatcacaaccat
gacaaaattatgaaggtggattcattgttcgtccagtgaatagtagttgttatttttcag
GTGGGAGAGGACACAGAGGAGACACCTCACCGCTGGTGGATAGAAACCTGTAAGAAACCT
GACAGCGTTTCCCTTCATTGCAGACAAGAAGCCATTTTCGAGTTGTTGGGAG
gtatacaaagggaagactgggttgtgttggggagggaagggggccaaaagagccttttgc
agttgggcctccaacatgtagtattgctttttaacctgctgctattgtgacacagcaaga
gaaccaagtaagagagggactgaactcagtgaataaacactatattcatgcctggttatg

 1.11 Intr +  24130  24249  120  2  0   83   98    99 0.956   9.95
ttctttatgaatgttaacttattctctaaaagtatcaatgggaagagagggaatacatgt
ttttaagtaattagtccaagaaaaacgtttcattaggaaatctgaaagatttaaaaatac
aagcaaatacagatgtattatgaatgactttctgtaaacttctttttgttgttgttaaag
GAATAACATCACCAGCAGAAATTCCGGCAGGTACTATTCTGGGACTGACAGTTGGGGATC
CTCGAATAAATTTGCCCCAAAAGAAGTCCAAAGCTTTGCCCAATCCAGAAAAATGCCAAG

gtaaagttccaaaaacaccccaggttttccttactatttcgagcagtccagtcttattag
aagaagagttctttctctgacacctctccagtaacttcatctgtaaaaaattagggcagt
ctccttacctgcccactttacaagctgattatgatctaaggaaatggtaggtgtggaagt

 1.12 Intr +  29929  30044  116  2  2   79   93    82 0.943   7.05
tgtcatagactgtaaaaccgactataagaataacttaatttcttgtcaagtaaattcttc
taagttaagtaaatgcctatgaaatattgttttgtaacaaaaggcctattgccaatgttt
ggagtttgacttcattgatctgaaggatgtggtttgaaggctatttcttttccctcttag
ATAATGAGAAAGTTAGACAGCTGCTTCTGGAGGGTGTGCCTGTGGAATGTACGCATAGCT
TTATCTGGAACCAAGATATCTGTAAGAGTGTCACAGAGAATAAAATCTCGGATCAG
gtaactaatagtgtaagggttattggtaaagtcatgaatgacaggttaaatatatcattc
tagagaccataaaaagttattcatacttcatagaattccatagactttcttttgttttca
aacaagttgttgatccctaactcatgatatgtactgtgattttcttctgttcttatggat

 1.13 Intr +  32176  32367  192  0  0   86   78    78 0.974   5.37
gaaaatatctgtaggaggaataccttatacttaaaatggctcacatttatttatttagaa
cgtttttctcttgcttttttaaaagagcatttaattttctaaagctgcttatagggagac
ccaggaggatctcccagaagactagggctatttgtcttgaattattttcttccactttag
GATTTAAACCGGATGAGGAGTGAATTGCTGGTGCCTGGGTCACAGCTTATTTTAGGTCCC
CATGAATCCAAGATACCTATACTTTTGATTCAGCAGCCAGGAAAAGTGACTGGTGAAGAT
CGACTAGGCTGGGGAAGTGGCTGGGATGTCCTACTCCCAAAGGGCTGGGGCATGGCTTTC
TGGATTCCATTT
gtaagttactttttgattctaacagttgcaatatttaaaatacattcctaataaatgcta
agtactcaaaatgttccagactttatgtacaacttaggaggaattgagtggtgtatttct
gcccttagagctatagtcctggatacaagatacttcatacatatagtccctggagccagg

 1.14 Intr +  33846  34000  155  2  2   73  116   144 0.984  13.65
tgaagcatgacgaagctcgattttattcatttttactattgcatggtaatccattgtgtg
tatttctatccattctccttttgaggggcgtttaggttgtttccattttcccccatataa
acattaagcaattcactttaagttggtagactgacagtatctttttgacatttcttttag
ATTTATCGAGGTGTGAGAGTCGGAGGGTTGAAAGAGTCTGCAGTGCATTCTCAGTATAAG
AGGTCGCCTAATGTCCCAGGCGATTTTCCAGACTGCCCTGCCGGGATGCTGTTTGCGGAA
GAGCAAGCTAAGAATCTTCTTGAAAAGTACAAAAG
gtaagaaactggcttctctaatttgataatgtattaaggaaaagagaagtgcctgcttat
attggtatcccaaacattaggatggctttggtaatttcatagacttttcagtgagttcag
cattactgagaaataattaagaagatattacttaagtgaggagattgtcttatatctatt

 1.15 Intr +  39411  39773  363  0  0   69  111   286 0.999  22.37
cagcctattattctttatcatatgtttcttggaaagcttttgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttaaaatagagatgcattataatggttataat
tattttagttttccaatcctaaattgttcaacattggttctcctgtatgtttttctttag
ACGCCCTCCTGCAAAACGGCCCAACTACGTTAAGCTTGGCACTCTGGCACCTTTCTGCTG
TCCCTGGGAGCAGTTAACTCAAGACTGGGAGTCAAGAGTCCAGGCTTACGAAGAACCTTC
TGTAGCTTCATCTCCAAATGGTAAGGAGAGTGACCTAAGAAGATCTGAGGTGCCTTGTGC
TCCCATGCCTAAAAAAACTCATCAGCCATCTGATGAAGTGGGCACATCCATAGAGCACCC
CAGGGAGGCAGAGGAGGTAATGGATGCAGGGTGTCAAGAATCGGCAGGGCCTGAGAGGAT
CACAGACCAGGAGGCCAGTGAAAACCATGTTGCTGCCACAGGGAGTCACCTCTGCGTTCT
CAG
gtaagtgtcggtgacttctgggtacattttggattatttattttaatattgaagaggcta
caggatgtaagcgttatcactgtttgtttatgcaaaatccaagtgaatttataggctttc
tggaagggaaagccagtcttttatatttcatagagggctcagggaaacagcttaataata

 1.16 Term +  40978  41632  655  1  1   40   42   400 0.527  23.08
aaaagaaaaatataagtactaaaatgtactacagtgtatttctaatttttaaaaaattgt
agttttgattcttatatagtataaaagaatcaaattaattctagcagtgtctaatcttct
gattgcatatttttttctggaacaaaatatcctcaaacgtatgtctccaacttcatgtag
GAGTAGAAAATTACTGAAGCAACTGTCAGCCTGGTGTGGGCCCAGTTCTGAGGATAGTCG
GGGAGGCCGGCGAGCTCCCGGCAGAGGCCAGCAAGGATTGACCAGAGAGGCTTGCCTGTC
CATCTTGGGCCACTTCCCCAGGGCCCTGGTTTGGGTCAGCCTGTCCCTGCTCAGCAAGGG
CAGCCCCGAGCCTCACACCATGATCTGTGTCCCAGCCAAGGAGGACTTCCTCCAGCTCCA
TGAGGACTGGCATTACTGTGGGCCCCAGGAATCCAAACACAGTGACCCATTCAGGAGCAA
GATCCTGAAACAGAAAGAGAAGAAGAAAAGGGAGAAGAGGCAGAAGCCAGGACGTGCCTC
TTCTGATGGCCCGGCGGGGGAAGAGCCCGTGGCTGGGCAGGAAGCTCTGACTCTAGGGCT
GTGGTCAGGCCCTCTGCCGCGTGTGACGTTGCACTGCTCCAGAACTCTCCTAGGCTTTGT
GACTCAGGGAGATTTTTCCATGGCTGTTGGCTGTGGAGAAGCCCTGGGGTTTGTTAGCTT
GACAGGCTTGCTGGATATGCTGTCCAGCCAGCCTGCAGCGCAGAGGGGCTTAGTGCTACT
GAGGCCTCCCGCCTCTCTGCAGTATCGATTTGCGAGGATTGCTATTGAGGTGTGA
atgcgtgcttgtatcccagcagggcatagataatacgttattattgtctgccaagttcta
catgtggagaatctgcttctgctttaaaatatcatgtgaaactccctggaaacaagaata
aaaaattatgtattatgcagatgatgaaatgtttacatcattccagtaatgtcattgatt

Predicted peptide sequence(s):


>POP1_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|1101_aa
XPSGEEAPAPALLASYWTDQPQQRLCPTAPAGGGLVRHSGNCSFGDAPGHVEEAPGLAHA
LSSALSRSFGSVGTVAEACHSDPGIPHSVWQSGPKAQGCSQGYPNPPAPTFSWTILILRG
ARVSMVFLSSLAEMSNAKERKHAKKMRNQPTNVTLSSGFVADRGVKHHSGGEKPFQAQKQ
ASTFAQARAAEISAMLKAVTQKSSNSLVFQTLPRHMRRRAMSHNVKRLPRRLQEIAQKEA
EKAVHQKKEHSKNKCHKARRCHMNRTLEFNRRQKKNIWLETHIWHAKRFHMVKKWGYCLG
ERPTVKSHRACYRAMTNRCLLQDLSYYCCLELKGKEEEILKALSGMCNIDTGLTFAAVHC
LSGKRQGSLVLYRVNKYPREMLGPVTFIWKSQRTPGDPSESRQLWIWLHPTLKQDILEEI
KAACQCVEPIKSAVCIADPLPTPSQEKSQTELPDEKIGKKRKRKDDGENAKPIKKIIGDG
TRDPCLPYSWISPTTGIIISDLTMEMNRFRLIGPLSHSILTEAIKAASVHTVGEDTEETP
HRWWIETCKKPDSVSLHCRQEAIFELLGGITSPAEIPAGTILGLTVGDPRINLPQKKSKA
LPNPEKCQDNEKVRQLLLEGVPVECTHSFIWNQDICKSVTENKISDQDLNRMRSELLVPG
SQLILGPHESKIPILLIQQPGKVTGEDRLGWGSGWDVLLPKGWGMAFWIPFIYRGVRVGG
LKESAVHSQYKRSPNVPGDFPDCPAGMLFAEEQAKNLLEKYKRRPPAKRPNYVKLGTLAP
FCCPWEQLTQDWESRVQAYEEPSVASSPNGKESDLRRSEVPCAPMPKKTHQPSDEVGTSI
EHPREAEEVMDAGCQESAGPERITDQEASENHVAATGSHLCVLRSRKLLKQLSAWCGPSS
EDSRGGRRAPGRGQQGLTREACLSILGHFPRALVWVSLSLLSKGSPEPHTMICVPAKEDF
LQLHEDWHYCGPQESKHSDPFRSKILKQKEKKKREKRQKPGRASSDGPAGEEPVAGQEAL
TLGLWSGPLPRVTLHCSRTLLGFVTQGDFSMAVGCGEALGFVSLTGLLDMLSSQPAAQRG
LVLLRPPASLQYRFARIAIEV