GENSCAN 1.0	Date run: 16-Jan-104	Time: 20:38:01

Sequence PMS2_1 : 38201 bp : 45.44% C+G : Isochore 2 (43 - 51 C+G%)

Parameter matrix: HumanIso.smat

Predicted genes/exons:

Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr..
----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------

 1.01 Init +    632   1007  376  1  1   67   70   257 0.717  16.90
ttttagtagagacgaggttttaccatgttggccaggctagtctcgaactcctgacctcag
gtgatccgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccacggcgccc
ggcctggataaatcttttaaaacataaaagtctgagtgagtccctggccggccggcacag
ATGCCGGGGTGGGGCCGTGAACCGGTTGGGACGCGCTCGCTCCGGCCTGGGGGGACCCGG
GCCAGCAGCCGGTCGCCGCGCGTGCGCACTGGGCGGGGGGCCCCGCGCTCCTACCTGCAC
GTGGCCAGCGCCCGGCGCTGGGCCGTAGCTCCTGCCGTGCACGTTGGGGAGCCGGTACAT
GCAGGTGGGAAGCTCCACACGGAGAGGCGCGCCGCCCCCGTGATAGGGCTTTACCTGGTA
CATCGGCATGGCAGAACCAAAGCAAAAGGGGGTAGCGCGTGCCAAAGGCCAACGCTCAGA
AACCGTCAGAGGTCACGACGGAGACCGGCCACCTCCCTTCTGACCCTGCTGCGGGCGTTC
GGGAAAACGCAGTCCG
gtgtgctctgattggcccaggctctttgacgtcacgaagtcgacctttgacagagccaat
aggcgaaaaggagagacgggaagtatttttgccgccccgcccggaaagggtggagcacaa
cgtcgaaagcagccaatgggagttcaggaggcggagcgcctgtgggagccctggagggaa

 1.02 Intr +   4218   4352  135  1  0   23  111    68 0.365   3.14
ggattgtaaaacagtgtttctatttctggatataataaatgtatttgctaatataataaa
tgaatagattagacccataaattatttacagtgttgagtcatttcccacagttaaaatca
ggatgaaaatatatagctgaatacttgatttgtttcttgtaactgatttctctagtacag
AACCTGCTAAGGCCATCAAACCTATTGATCGGAAGTCAGTCCATCAGATTTGCTCTGGGC
AGGTGGTACTGAGTCTAAGCACTGCGGTAAAGGAGTTAGTAGAAAACAGTCTGGATGCTG
GTGCCACTAATATTG
gtaagtttgggagagttttaagccacaagaaatgatctgtgaatgttgttgtagttaaga
aacatttgttattgaaataagactatcaagtgttgatgtagtaataaattattattttta
agttgaagttagcacctattatgtgcctagtacttagctaggtagtaataataataacag

 1.03 Intr +   6186   6272   87  1  0   65   97   127 0.999  11.24
gggctagtaaatagccagaaaggactttataacaatgaaatatacaaaatgacactagta
tgtttaactaaaggtatagttatgactcttaaatttgcatatgttataaataatgtcaat
ataaaaactgatagcatgggtccgtttttaataaatatgtaaatattttaaactttctag
ATCTAAAGCTTAAGGACTATGGAGTGGATCTTATTGAAGTTTCAGACAATGGATGTGGGG
TAGAAGAAGAAAACTTCGAAGGCTTAA
gtaagttgactttttctaatcctattataaaataattgggtcacatgtctcagaattttg
agtaacactgtcttgggaaatgcaaaaacagttttttaaagccagttactagatatcatg
tatattttgttgttatagcacttgagatatcttagtccttactttacactctctttcagc

 1.04 Intr +   6452   6554  103  0  1   64   44    38 0.996  -3.77
agtaagttgactttttctaatcctattataaaataattgggtcacatgtctcagaatttt
gagtaacactgtcttgggaaatgcaaaaacagttttttaaagccagttactagatatcat
gtatattttgttgttatagcacttgagatatcttagtccttactttacactctctttcag
CTCTGAAACATCACACATCTAAGATTCAAGAGTTTGCCGACCTAACTCAGGTTGAAACTT
TTGGCTTTCGGGGGGAAGCTCTGAGCTCACTTTGTGCACTGAG
gtgatacaatatttttatccactcacttgaccccttagagaaacctctctgaaaattaat
tggaatcattattattttcagttttctatctcaacatctcaacttctagcttctgaattc
tgttttgtctcgctgccaatctaagtcatagtacttctgaaatgtgagcaataaatgaat

 1.05 Intr +   7608   7791  184  0  1   91   87   129 0.982  12.89
tttagatgccaaaccttagattttatgatgactcctcaaccatttagatcttgattatct
cagagggatcgtcagctttttaagaaaattttgagagaaaagcaagtgaagaaaagagta
gtcagtgcccaacatcatgggtctctcactgaacacaccatgcctggtattctctcacag
CGATGTCACCATTTCTACCTGCCACGCATCGGCGAAGGTTGGAACTCGACTGATGTTTGA
TCACAATGGGAAAATTATCCAGAAAACCCCCTACCCCCGCCCCAGAGGGACCACAGTCAG
CGTGCAGCAGTTATTTTCCACACTACCTGTGCGCCATAAGGAATTTCAAAGGAATATTAA
GAAG
gtacagtaaattaatcctggttttcaagagtattggttaatgcacatgagcaaaagattt
actaaagatgtttattcttcagttgattctcttcccataaattattgagaaatgctttat
ttgcatttctcattaaagatttaacattaaagacttaactttaggatgatttactttttt

 1.06 Intr +  10969  11136  168  0  0   45   72   149 0.950   9.14
gctctgcgttcctttctgtagaatataggaagacacctctttacagatcattctgtcaac
agtgcttcccttgatttgtgcgatgatgtgagaaccttgcgttggatgttgtaacttgag
ctgtgtaattcctataatattaaagtaatgtagaatattgtgtttgtgttttttaaacag
GAGTATGCCAAAATGGTCCAGGTCTTACATGCATACTGTATCATTTCAGCAGGCATCCGT
GTAAGTTGCACCAATCAGCTTGGACAAGGAAAACGACAGCCTGTGGTATGCACAGGTGGA
AGCCCCAGCATAAAGGAAAATATCGGCTCTGTGTTTGGGCAGAAGCAG
gtagtgatggccggttacttcaacgcctcttattgctctagtgattatagcgggtttcca
ttgtcccttccagtagaatggagaataaaatcttagaattgattttttttttttttttga
gagggagtctcgcactgctgcccaggctggagtgcagtggtgttgtcttggctcactgca

 1.07 Intr +  18187  18271   85  0  1   96  111    42 0.989   6.69
catgattgctccactgcactccaggctgtgacaaggcgagaccttgactcaaaaaaaaaa
aaaacaaaaaagtatccccttctaagaacatgctggttggttagaatagaatgttgttag
aatgcggggggctgggaacatttgtcatttattcttttctactccttgtattttgtgcag
GTCTGCAGACTCGTGAATGAGGTCTACCACATGTATAATCGACACCAGTATCCATTTGTT
GTTCTTAACATTTCTGTTGATTCAG
gtaagttccattggcatttcagtacaactagtgactaatgcctcaaagaataaaatgaaa
ttctacagctctgctatgactggaatgagataacaatttatggtcatgtaagttttttgt
ttttgtttttttttgagacggggtcttgctctgtcacccaggctggagtgtggtggcgtg

 1.08 Intr +  20289  20444  156  1  0  103  116   114 0.999  15.68
ttcggaggctgaggcagggagaatcacttgaacccaggaggcggaggttgcagtgagctg
agatcgcgccactgcactccagcctaggcgacagagtgagacgctgtctgaaaataataa
ttaataaataaaataaaagtgaatttaaacataataaatatgttttcttttttgccttag
AATGCGTTGATATCAATGTTACTCCAGATAAAAGGCAAATTTTGCTACAAGAGGAAAAGC
TTTTGTTGGCAGTTTTAAAGACCTCTTTGATAGGAATGTTTGATAGTGATGTCAACAAGC
TAAATGTCAGTCAGCAGCCACTGCTGGATGTTGAAG
gtaagaaaaatacagtgtacaaacagcttctaaagcttttagctaatgtgtttccttatt
ttttccaagtaaacttttttttgacatgaaaacaaagtctcttatattattttatcattt
ttaattcttttttgagacagggacttgctctgtcacccaggctggactgcagtggtgcca

 1.09 Intr +  22624  23485  862  2  1   88   98   360 0.985  27.41
taacaggcgtaagccaccacacctggcccatattatagttttattttgaacattgaactg
tgttcatctgtgtaattagcatgtggatctcctcttttgtgaagtatctgttcacataag
cacgtcctctcaccatttcaggatagtccctgaccctcttctccgtccacgtttgcttag
GTAACTTAATAAAAATGCATGCAGCGGATTTGGAAAAGCCCATGGTAGAAAAGCAGGATC
AATCCCCTTCATTAAGGACTGGAGAAGAAAAAAAAGACGTGTCCATTTCCAGACTGCGAG
AGGCCTTTTCTCTTCGTCACACAACAGAGAACAAGCCTCACAGCCCAAAGACTCCAGAAC
CAAGAAGGAGCCCTCTAGGACAGAAAAGGGGTATGCTGTCTTCTAGCACTTCAGGTGCCA
TCTCTGACAAAGGCGTCCTGAGACCTCAGAAAGAGGCAGTGAGTTCCAGTCACGGACCCA
GTGACCCTACGGACAGAGCGGAGGTGGAGAAGGACTCGGGGCACGGCAGCACTTCCGTGG
ATTCTGAGGGGTTCAGCATCCCAGACACGGGCAGTCACTGCAGCAGCGAGTATGCGGCCA
GCTCCCCAGGGGACAGGGGCTCGCAGGAACATGTGGACTCTCAGGAGAAAGCGCCTAAAA
CTGACGACTCTTTTTCAGATGTGGACTGCCATTCAAACCAGGAAGATACCGGATGTAAAT
TTCGAGTTTTGCCTCAGCCAACTAATCTCGCAACCCCAAACACAAAGCGTTTTAAAAAAG
AAGAAATTCTTTCCAGTTCTGACATTTGTCAAAAGTTAGTAAATACTCAGGACATGTCAG
CCTCTCAGGTTGATGTAGCTGTGAAAATTAATAAGAAAGTTGTGCCCCTGGACTTTTCTA
TGAGTTCTTTAGCTAAACGAATAAAGCAGTTACATCATGAAGCACAGCAAAGTGAAGGGG
AACAGAATTACAGGAAGTTTAGGGCAAAGATTTGTCCTGGAGAAAATCAAGCAGCCGAAG
ATGAACTAAGAAAAGAGATAAG
gtaaagttttaattttttactttttctctttttatctaaaatttttatttttatttttta
tttttttgagacagagtcttgctctgttgcgcaggctggaatgcagtggcatgatcttgg
ctcactgcagcctccacctcccgggttcaagcgtttctcctgcctcagcctcctgagtag

 1.10 Intr +  27253  27420  168  1  0   77   75   205 0.972  17.16
cattgcactgtagcctgggtgacagaacgagactctgtttcaaaaaaaaagaaagcggga
tggctagggactttattttgtttttgtattgtttgactttttttttattacagtgttcta
taacataatcagaaaaataatcttgtaaaatgtctgataattaacattttctacctgcag
TAAAACGATGTTTGCAGAAATGGAAATCATTGGTCAGTTTAACCTGGGATTTATAATAAC
CAAACTGAATGAGGATATCTTCATAGTGGACCAGCATGCCACGGACGAGAAGTATAACTT
CGAGATGCTGCAGCAGCACACCGTGCTCCAGGGGCAGAGGCTCATAGC
gtgagtgtgtttagtgttcattcccagactccccctcaaattgaagatctaatagaggcc
aaggcaggaggatcacaagaggccaggagtttgagaccagcccggacaacacagcaagac
cttgtatctactttaaaaaagaagagatctaggaaggaggggtgtaaaaaataaaaaata

 1.11 Intr +  30233  30337  105  2  0   66   46    99 0.850   2.83
cagaatgaaggatatctttatgtgtggctctgcaaacatcagcggtccatcctggggctt
ggcacagattgttgtccctgtctagaatacttgtcctgcaccctgcacccacttctcccc
cgttacctgattaactctcttatccccggactcagctcaaaggtcacttcctgaccccag
GGTGAAGTCTCTCTATGACACTGGCTGCTTTTTCTTCCTGACCTTCCTGTCGTTTCTCAT
CATAATCGACTTGCCTGAGTATTTGCTCAACGTCTTTCTTCCCCG
gtaatctgttggctccaggaccaagcctgtgtttgctcaccagctgtctcctgccttgag
cagtgtttgtcttatccagcactcaggaccagatgcagtggctcacactcgtaatcccag
cactttgggaggctgaagtggaaggatcgcttgagcccaggagtttgagagcagcctggg

 1.12 Intr +  31548  31648  101  0  2  105  115    61 0.999  10.25
agagaaaattaaaaggaacttctcaggaagttttgtgacacttagctgagtagtgttgtt
atttgtgttgttattttgacatgaattcaaaatacagtattgttgttttcatttcatttc
tgctgtaaagctaaatgtttgacttcaggatatggtttgaatcatttttgtgtttttcag
ACCTCAGACTCTCAACTTAACTGCTGTTAATGAAGCTGTTCTGATAGAAAATCTGGAAAT
ATTTAGAAAGAATGGCTTTGATTTTGTTATCGATGAAAATG
gtaagttattaattagaactatagcggctgggtgtggtggctcacgtctgtaatcccagc
actctgggaggccaaggcgggcagatcgcctgaggtcaggagtttgagaccagcctggct
aacatggtgaaaccccatctctactgaaaatacaaaaagtagccgggcgtggtggcgggt

 1.13 Intr +  32487  32656  170  1  2   57  123   197 0.946  19.77
ccatgttagccaggatggtctgtatctcctgacctcatgatccgctggcctcagcctccc
aaagtgcagggattacaggcgtgagccaccacgcccggcctcagatgttcatcctaagta
gctttcaagtgaaacgtgtttgtcaagtcatggatttttctcaaaattgtattcttttag
CTCCAGTCACTGAAAGGGCTAAACTGATTTCCTTGCCAACTAGTAAAAACTGGACCTTCG
GACCCCAGGACGTCGATGAACTGATCTTCATGCTGAGCGACAGCCCTGGGGTCATGTGCC
GGCCTTCCCGAGTCAAGCAGATGTTTGCCTCCAGAGCCTGCCGGAAGTCG
gtaagtaaagaaagcctggctgtcagctcagctgctcaagcttgcagtcgaggaaggtct
cagcccagctcctgatttggtcaaggttgtaaacgcctttgtgattgccaggggtcattt
tacacagagagctacgtgcagcgtcgtagctgagcatctgtgtcgtctgcgttctctgtg

 1.14 Term +  36702  36845  144  2  0   61   47    89 0.753   0.01
cagaagggtggagggctgagatctagaacctaggcttctctgggggaaggtttttcaggg
aaggtagtttttgagctgtaatcttgtccagccttattttagagaagaatgcttctgaag
agctgccattctgacgtcaaaaaactactaaaacgttgaaccattgtgtctcacactcag
GTGATGATTGGGACTGCTCTTAACACAAGCGAGATGAAGAAACTGATCACCCACATGGGG
GAGATGGACCACCCCTGGAACTGTCCCCATGGAAGGCCAACCATGAGACACATCGCCAAC
CTGGGTGTCATTTCTCAGAACTGA
ccgtagtcactgtatggaataattggttttatcgcagatttttatgttttgaaagacaga
gtcttcactaaccttttttgttttaaaatgaacctgctacttaaaaaaaatacacatcac
acccatttaaaagtgatcttgagaaccttttcaaaccagatggagcattgcttgcaaatt

Predicted peptide sequence(s):


>PMS2_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|947_aa
MPGWGREPVGTRSLRPGGTRASSRSPRVRTGRGAPRSYLHVASARRWAVAPAVHVGEPVH
AGGKLHTERRAAPVIGLYLVHRHGRTKAKGGSACQRPTLRNRQRSRRRPATSLLTLLRAF
GKTQSEPAKAIKPIDRKSVHQICSGQVVLSLSTAVKELVENSLDAGATNIDLKLKDYGVD
LIEVSDNGCGVEEENFEGLTLKHHTSKIQEFADLTQVETFGFRGEALSSLCALSDVTIST
CHASAKVGTRLMFDHNGKIIQKTPYPRPRGTTVSVQQLFSTLPVRHKEFQRNIKKEYAKM
VQVLHAYCIISAGIRVSCTNQLGQGKRQPVVCTGGSPSIKENIGSVFGQKQVCRLVNEVY
HMYNRHQYPFVVLNISVDSECVDINVTPDKRQILLQEEKLLLAVLKTSLIGMFDSDVNKL
NVSQQPLLDVEGNLIKMHAADLEKPMVEKQDQSPSLRTGEEKKDVSISRLREAFSLRHTT
ENKPHSPKTPEPRRSPLGQKRGMLSSSTSGAISDKGVLRPQKEAVSSSHGPSDPTDRAEV
EKDSGHGSTSVDSEGFSIPDTGSHCSSEYAASSPGDRGSQEHVDSQEKAPKTDDSFSDVD
CHSNQEDTGCKFRVLPQPTNLATPNTKRFKKEEILSSSDICQKLVNTQDMSASQVDVAVK
INKKVVPLDFSMSSLAKRIKQLHHEAQQSEGEQNYRKFRAKICPGENQAAEDELRKEISK
TMFAEMEIIGQFNLGFIITKLNEDIFIVDQHATDEKYNFEMLQQHTVLQGQRLIAVKSLY
DTGCFFFLTFLSFLIIIDLPEYLLNVFLPRPQTLNLTAVNEAVLIENLEIFRKNGFDFVI
DENAPVTERAKLISLPTSKNWTFGPQDVDELIFMLSDSPGVMCRPSRVKQMFASRACRKS
VMIGTALNTSEMKKLITHMGEMDHPWNCPHGRPTMRHIANLGVISQN