GENSCAN 1.0	Date run: 16-Jan-104	Time: 14:19:43

Sequence DDX43_1 : 24999 bp : 40.99% C+G : Isochore 1 ( 0 - 43 C+G%)

Parameter matrix: HumanIso.smat

Predicted genes/exons:

Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr..
----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------

 1.01 Intr +   1308   1601  294  2  0   46   31   241 0.357  10.48
aaccgattggctaaaactgggaaagtcccgcccacaacgctcactggccaatggctgcgt
gaaatcagtgcgaagtgggcgggatagagagcgtgggcgggggggctagcctcgtgcggg
ctccttaagtagcggctgcgtggcttccctggcacgctactcttacgacgtcacggtcag
GTGGTGCAGAGCTGGACGGCAACGACGTCGGACGCGCCCCTTCTTGGAACAATGTCCCAC
CACGGAGGAGCTCCCAAGGCCTCTACGTGGGTCGTTGCTAGTCGGCGAAGCTCGACAGTG
TCCCGAGCGCCAGAGAGGAGGCCGGCGGAGGAGTTGAATCGAACAGGTCCTGAGGGATAT
AGTGTCGGCAGAGGTGGTCGCTGGAGAGGCACCTCTAGGCCCCCGGAGGCCGTGGCCGCT
GGTCACGAGGAACTGCCGCTGTGTTTTGCTTTGAAGAGCCACTTTGTTGGCGCG
gtaatcggtgagaatgggagtggctggcagggcaggataggtggggccaggggcggagcc
tgggcgaaggcatttcctccccactgcctcacctccaatcagctgccacctagtgaggtt
caggtctctcccagagctatttgtaaaacctggggatagagtataatttaatctggccgg

 1.02 Intr +   6687   6816  130  2  1   98  111   145 0.998  17.15
ataagtagtattcctctctaactagaaatttagacattgattggtggtaatactgtattt
actttatactgtaatagattttgaagttgagtgattgttggaaggggttaggggcttagg
gaactttttatgttttttagggaaattttaagtctcacctctttttccccttgtacctag
ATAATACAAGAACAACCAGAATCATTAGTCAAAATTTTTGGCAGCAAGGCAATGCAAACG
AAAGCAAAAGCAGTGATAGACAATTTTGTTAAAAAGCTAGAAGAAAATTACAATTCAGAA
TGCGGAATTG
gtaagtaattttctcccactgaacccctttaaaagtttttaatttcattcagtgttataa
gccattatacctgatttcactttctgattcaaagcattaggctgccataaatgcagtctt
aatgattttttactatgaatgaaagcccagaatatttttcctcaaattaaaataccagag

 1.03 Intr +   8312   8443  132  0  0   48   82    67 0.706   1.80
gtactcccagctgctggggaggctgaggcaagagaatggcgggaacccgggaggtggagc
ttgcagtgagccgagatcgcgccactgcactccagcctgggggacagagcgagactccat
ctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatagaaaaaaactaatcgatacaaatgtttttaacag
ATACTGCATTCCAACCTTCTGTTGGAAAAGATGGAAGCACAGATAACAATGTTGTTGCAG
GAGATCGGCCATTGATAGATTGGGATCAAATTAGAGAGGAAGGTTTGAAATGGCAAAAAA
CAAAGTGGGCAG
gtcagtgctgcttcctaatatttacatatattgtttctgttaactgcagtttttattctc
tgtacaatgtctgtgctttatttttagtaatgaaatgtatatgaaaatagtaaaatctaa
aatgctgcaattagtccctaggttatgatagtttctatgttatcagctgtcatttatgct

 1.04 Intr +  11143  11224   82  2  1   66   90    53 0.930   1.08
tgcctaacctccagaaagggagatctcttcgatgggagcaagcctcgttggcaaagtgta
gaactatcaaatggtatgcatggtaaataaaatatattgtagtatgatttctgtagcttt
gactaagtattcatgatgctgtaaaatttatcaaagtgtggattttcgcctttgtcccag
ATTTACCACCAATTAAGAAAAACTTTTATAAAGAGTCCACTGCCACAAGTGCCATGTCAA
AAGTAGAAGCAGATAGTTGGAG
gtgggtagtttcattacctagttgtgtaagtatttgtatagttacgttattggtattaac
acttcgggcaaatgtgaaatgatatttgaaggctacgccttcaatattcaaatgaaaatg
tgtcaacttacatgatattttagaacattgttgtctagtaaaacttcctgcagtgatgga

 1.05 Intr +  12132  12288  157  0  1   45   85   109 0.969   5.39
agataagagacagatggactcctgcttctatttctttatgcatttcattataacttccct
gacagtctcattttaatcagttgcagttgaatttctagataagaccagcactgattttgg
agaatgtcttgcttggggagtaaagtgaggaaagccactgatgttttttattctttgaag
GAAAGAAAATTTTAATATAACGTGGGATGACTTGAAGGATGGGGAGAAACGACCTATCCC
CAATCCTACCTGCACATTTGATGACGCCTTTCAATGTTATCCTGAGGTTATGGAAAACAT
TAAAAAGGCAGGTTTTCAAAAGCCAACACCTATTCAG
gtatgctttcattaattacaatatttcactcaatgtttttcttcgaaaccagtgatatct
gattgttagaagactccagggagcaactgtcttagcattccaccagcaccttctccctag
agttcaaaaaatctttgttgaaagaagtttggagctgggaaagaaggaacagttggcaaa

 1.06 Intr +  12823  12935  113  0  2   77  110    12 0.845   0.56
atttttgtatttttagtagagacggtttctctatgttggtcaggctagtctcgaactccc
gacctcaggagatctgcccgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagcca
ctgcgcccagcaaaagatgtactttttgtgttaatgtttatcattccgtttcagtcacag
GCATGGCCCATTGTGTTGCAAGGAATAGATCTTATAGGAGTAGCCCAGACTGGAACAGGA
AAGACATTGTGTTATTTAATGCCTGGATTTATTCATCTGGTCCTTCAACCCAG
gtaagaattcctatggctggtttcttcttatagaggtttaatagatttagatatcaaaaa
tgtaattaaagtttctttacctattgcttgatccaaaggtaatgcctagcttcagagaag
atgcaaggaattaaacacttagattgtgctggtgaaagtataaactggcaaaacattttt

 1.07 Intr +  14413  14554  142  1  1   95   17    98 0.877   2.83
ggtacaaatattgctctttaggatacaacattatggattgatgggtgtacataattctca
gaaaggggcagatacccctaaaggtacctgataattgatttttatcccttttattggatt
ttaagttgtgatgagatattctgtgcctaaacattaacctttagattttttctttttaag
TGTTTGTGTATATGGTGGTGGAAATAGAGATGAACAAATAGAAGAGCTTAAAAAAGGTGT
AGATATCATAATTGCAACTCCCGGAAGATTGAATGATCTGCAAATGAGTAACTTCGTCAA
TCTGAAGAATATAACCTACTTG
gtaatcatggaaataggggtttgagatgctgggttcaaaaataactgaactggccgggcg
cagtgggtcacgcctgtaatccgagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacctaag
gtcaggagttcgagaccaacctgaccaatatgatgaaactccgtctctactaaaaataca

 1.08 Intr +  15701  15801  101  1  2  107   98    93 0.913  10.19
gtagacagtgtacaatgacaaattgcttagtattctgacctctggagaaattagaatcgt
ggcttaagtaataggggaaatgagaaaagcctttcttagtgttctactaataaagaaagc
atatgtattattacctgcctcccatatctaatctaaccacattcttttttgtcaatgcag
GTTTTAGATGAAGCAGACAAGATGTTGGACATGGGATTTGAACCCCAGATAATGAAGATT
TTGTTAGATGTGCGCCCAGATAGGCAGACAGTTATGACCAG
gtacgtatatgcttaattactgtgtgcagaatagaaatcagtggaatagaatctcattct
gtttggattttcccacaatatttgagcattacttggaagtgttgaaatctttaggtgaaa
gatctcataacattggaagtagaacagtgtaacaataagtgcttattcatgactattggg

 1.09 Intr +  20423  20532  110  2  2   47   91    20 0.524  -2.79
gtattttttcttgtgtgtccattataattaattaaattgattaggatcatttctatttgt
atactaattccaaatgggggtgataagtctgttatgttactttagatttttgctaacaga
agtaaaactggtggcattagaataagcacctaagaatgctgagtttatcttttgcttcag
TGCGGATCACTTATCAAGTGACCTAATACTTGGAAATATATCAGTAGAGTCTCTGCATGG
AGATAGAGAACAGAGAGATCGGGAGAAAGCATTAGAGAACTTTAAAACAG
gtatgtttatgtaattagtatttcatacagtttaaaattagtgcaatacctgggcttggc
tgagtaacatcttttcatgaaacccatttatttctaagatctgtcctcaccttctgtatc
ctacaactacactcattagagctctaaacattaatctgcctttaagtattaaataaacac

 1.10 Intr +  21001  21139  139  2  1   79  110    98 0.484   9.70
tgctgaaccatggtatcttgtaacttgccggcagttacttttccattttcacaaagtaag
cattttaatgtaaacagtaagaaataaaattgattaaattagttagggcaaatattattt
ttagatcttgggttggtttataccagaatggttcagtgttcatttggctttactttttag
GCAAAGTGAGAATACTAATTGCAACTGATCTAGCCTCTAGAGGACTTGATGTCCATGACG
TTACACATGTCTATAATTTTGACTTTCCACGGAATATTGAAGAATACGTACACCGAATAG
GGCGCACGGGAAGAGCAGG
gtaagtaagcttagtccacccatgaaaggccaattctagattctccttattcctctcaca
aacttcttgcccagaaaaccattttattctattacctataatttttcagctacttcccag
attatacttgctactttatttatccctgttcatttggcttgttccagactcaaccagatt

Predicted peptide sequence(s):


>DDX43_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|467_aa
VVQSWTATTSDAPLLGTMSHHGGAPKASTWVVASRRSSTVSRAPERRPAEELNRTGPEGY
SVGRGGRWRGTSRPPEAVAAGHEELPLCFALKSHFVGAIIQEQPESLVKIFGSKAMQTKA
KAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQ
KTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFD
DAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVL
QPSVCVYGGGNRDEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLD
MGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKT
GKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAX