GENSCAN 1.0	Date run: 16-Jan-104	Time: 09:22:36

Sequence CDKL2_1 : 53624 bp : 39.48% C+G : Isochore 1 ( 0 - 43 C+G%)

Parameter matrix: HumanIso.smat

Predicted genes/exons:

Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr..
----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------

 1.01 Init +    684   1128  445  2  1   81   84   233 0.567  16.43
cagtgttttccctcactttcaatggccagactggccttcccaaggtccctcctaacgtca
ggtctgtcatcacctaccttcttccaccttgcctcgcctactaatcatcacctcctaaac
tgtcaccgttatctcctacctggctcacactggccccaccgcccagaacagaaaggaagc
ATGGAATCCCGGTCAGGCCGCGCCTACGCGACTCAGGGCGCCCGGCGCCCGCCCCTGCCC
CAGCGGCGATGCTATGAGGGAAACCGTATCGCATTTTGCATAGTCTTCGCAGTCCTACAT
AACCGCCACCTTTACCCTTCGCGTGGGCATCACAATCGCCTCCTCCCGCTGGGGAAGGCA
GAAAGGCGCCTCCTGACGAGAACCAAGGCGTGTGGGGACGCAGGGCCTCTGCGTGTCAGG
GAGCAGAACCTGGGCCGAGCCCTAGGTGAAGGGGCGGGGTGGTTGGCCCTGAGCCAATCA
TGGCTCGTGACGACTCGGCTCGGCCAATCAGAAGAAGGGAGGCCTGGCGCTCTCGGGGCG
GGTGAGAAACCGCCCCCCCTTGCAGCTCCGCGGCCAACGCCTTCGCCCAGGGGTAGTTGG
AGCGGTGCAGGTTCCCAGGCTCCAG
gtactgggcgccttacgagctgggaggtggtgcctctcacccagctaattgctctctagc
ccttggccttcacaggtgttggtgcctgccgtgaacgcattctgacctgggccgtatctg
tctcccaagactttgtgcctatggttggggacagagtgaggtcgttgccttgacgacgac

 1.02 Intr +   1204   1283   80  2  2  104   42    90 0.901   4.35
ggcctggcgctctcggggcgggtgagaaaccgcccccccttgcagctccgcggccaacgc
cttcgcccaggggtagttggagcggtgcaggttcccaggctccaggtactgggcgcctta
cgagctgggaggtggtgcctctcacccagctaattgctctctagcccttggccttcacag
GTGTTGGTGCCTGCCGTGAACGCATTCTGACCTGGGCCGTATCTGTCTCCCAAGACTTTG
TGCCTATGGTTGGGGACAGA
gtgaggtcgttgccttgacgacgacagcatgcggcccgtggtcctcctaagtgtgagctt
gcggcggaccgaggcccacctgcctccctgcctgcttcgccctggactcgtgactgcgtc
cgcagaagaaatcacaacagcgctggaattgctagtttgctaggcagcatcttttggacc

 1.03 Term +   1335   1550  216  2  0   54   42   115 0.576  -0.34
gtggtgcctctcacccagctaattgctctctagcccttggccttcacaggtgttggtgcc
tgccgtgaacgcattctgacctgggccgtatctgtctcccaagactttgtgcctatggtt
ggggacagagtgaggtcgttgccttgacgacgacagcatgcggcccgtggtcctcctaag
TGTGAGCTTGCGGCGGACCGAGGCCCACCTGCCTCCCTGCCTGCTTCGCCCTGGACTCGT
GACTGCGTCCGCAGAAGAAATCACAACAGCGCTGGAATTGCTAGTTTGCTAGGCAGCATC
TTTTGGACCTGCGAACCATATGCATTTCACCTCAAATTTGTTTCCAAGTTGAAAACCTTT
GGGTCTTTCTATGCGAACGGATTGAAGAAACGGTAA
gtatagtacgttttaaagcttctattatctcgttctttgatctataaaagatttcaatct
tttttttttttttttttttttttttttttttttttttttgagacggagtttcactcttgt
tgcccaggctggagtgcaatggcatggtctcggctcaccgcaacctctgcctcctgggtt

 2.01 Init +   5600   5767  168  1  0   46  113   167 0.831  14.59
tgtagaaacactaggaaattgtgaattaatacaggacagccatgaacacagtgactaata
tggaaaacaagcagggaagaattaatttgctgggaaggcggaggaaattaacgtactcaa
ctttgttaaatctatgttttggttttcacagcaaaaagtttctacggactttaaattaaa
ATGGAAAAATATGAAAACCTGGGTTTGGTTGGAGAAGGGAGTTATGGAATGGTGATGAAG
TGTAGGAATAAAGATACTGGAAGAATTGTGGCCATAAAGAAGTTCTTAGAAAGTGACGAT
GACAAAATGGTTAAAAAGATTGCAATGCGAGAAATCAAGTTACTAAAG
gtgagtaaatgcatatattgaatcaaaaaatatgagtataagtttcttttttggcaataa
gaagaaatacaatgattagatatgcaaattcatttatctggtgaatgtaaacctgatttt
aaaagtgtttgttccttctctctatatctttctgtgtatttatcaatcatctatctatag

 2.02 Intr +  17139  17333  195  2  0   60  101    49 0.755   2.09
caattgtagtttaaaaaccagaatatgcttttacaatttacactatgtatgcattttatt
tatatatttttcttacgctgagatctattttaaataattaattgctaataatttgatctt
agtttatataaactattttgcatttttaaataacagctattttgcattttttaataacag
CAACTTAGGCATGAAAACTTGGTGAATCTCTTGGAAGTGTGTAAGAAAAAAAAACGATGG
TACCTAGTCTTTGAATTTGTTGACCACACAATTCTTGATGACTTGGAGCTCTTTCCAAAT
GGACTAGACTACCAAGTAGTTCAAAAGTATTTGTTTCAGATTATTAATGGAATTGGATTT
TGTCACAGTCACAAT
gtaagtattgggtttaaataatttgctttatcacatatttattcattaatcctttaatct
gtcttattgatttatgcatttgaaaataagttgcagacatcagtatactttaacactaaa
tacttcatctgtgcatctattaattggagttaaatatttgttttctgagttttttgtttg

 2.03 Intr +  24227  24405  179  1  2   74   71   106 0.923   5.30
atttcaagtatagatgttctttcttgcccaactaggtcctaggttgttgagggctaggag
caactttctatgcttttgtttgtattctttatagggacaacatacaatgccctgcacata
gcaggtgccccaaaataattaattttatttaacatccgtcacactctgcttcttgtctag
ATCATACACAGAGATATAAAGCCAGAGAATATATTAGTCTCCCAGTCTGGCGTTGTCAAG
CTATGCGATTTTGGATTTGCGCGAACATTGGCAGCTCCTGGGGAGGTTTATACTGATTAT
GTGGCAACCCGATGGTACAGAGCTCCAGAACTATTGGTTGGTGATGTCAAGTATGGCAA
gtaagacatcagtaatggggaggagtagatttttactcttgcttcttgctatagtggaat
atgtttatgatatagtaaatgatccctctaatactgaaaggaaggcttgagtttcaggga
ctatataaagtaaattgtaatcatttttggtgcttcccctttaaacattcctgtgaaaca

 2.04 Intr +  25954  26066  113  1  2   82   82    34 0.979   1.30
ttttttttttggattttgggatatttgcattataccattggagcatgccaaatctgagaa
tctgaaatctgaaatgctctggttggcatttcctttgagcatcacctcagtgctcaaaaa
gctttgggttttggagcatattaggatgccagattttacaccacattgcttttctttcag
GGCTGTTGATGTGTGGGCCATTGGTTGTCTGGTAACTGAAATGTTCATGGGGGAACCCCT
ATTTCCTGGAGATTCTGATATTGATCAGCTATATCATATTATGATGTGTTTAG
gtaaggttacacatctgcattttaaattttagagatttttctgcatatttgtttgtgcct
gtgtgtttgtgattttttaagctgttgcattaaagattatatatgttttaagtgaaggta
gggagcatataggaaaactctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttttgagatggagttt

 2.05 Intr +  27632  27771  140  0  2   92   84    88 0.982   8.06
ccttaagactgccatataccaccacagtaacggcattgtctttggtcaattttgcatgtt
gagagagccccaaactccataagctgtgttccactatttcctctacttcacaccacctgt
ctcttcaccatttctatcatgttgtataataacagagatatgtgctgttttcacttccag
GTAATCTAATTCCAAGGCATCAGGAGCTTTTTAATAAAAATCCTGTGTTTGCTGGAGTAA
GGTTGCCTGAAATCAAGGAAAGAGAACCTCTTGAAAGACGCTATCCTAAGCTCTCTGAAG
TGGTGATAGATTTAGCAAAG
gtaatcatacttattgtttacactttatgacagggaatttatgcactatcaagacctttt
ttttttttttttacttgtctagttgatcttttttttttttttttgatggagtcttgctct
gtcacacaggctggagtgctgtggcatgatctcggctcactgcaagcttcaccattcttc

 2.06 Intr +  31219  31307   89  0  2   82   65    54 0.977   0.35
gaggtcaaggctgcggttaagtagtgatcacaccactgcactctagcctgggcaacagag
tgagaccctgtcttaaaaaaaaaaatcgttgactataaagaggattttttttctatattt
ataaatttaaatgtaggtagtttttcttgatatgaactctaagtgttcttaatttttcag
AAATGCTTACATATTGACCCCGACAAAAGACCCTTCTGTGCTGAGCTCCTACACCATGAT
TTCTTTCAAATGGATGGATTTGCTGAGAG
gtatagtacttacccatgtttttcaggccataccaacctagggttaaagtcttccacaat
agtcacaaatagcacttctcttatttctgttcccacctactttgcaggatctcagatatc
taccactctacccccatattcccttagcaataatgcagttcctaggggtggtctcctaca

 2.07 Intr +  33376  33511  136  1  1   63   99    86 0.980   6.85
gatccccaaagatctacacaccaccctttccaaactgctgatctaggccaggatttttct
catttttaataacatagactagtttaacattcaatttttaaaaaataaatatcttgaaag
tcaatttttttgtaggtttatccatgtcttacaattttattttattatatttttatgtag
GTTTTCCCAAGAACTACAGTTAAAAGTACAGAAAGATGCCAGAAATGTTTCTTTATCTAA
AAAATCCCAAAACAGAAAGAAGGAAAAAGAAAAAGATGATTCCTTAGTTGAAGAAAGAAA
AACACTTGTGGTACAG
gtaaatgttcatgtttcacattttagatttaatatacttatttttttaaattttttgaga
aaaaatatgattttgaaaaaagttttctgagcagtgagcaaattgttaacttttagttta
gttgtaaaaatgtatcttctcagtagatattacctgtttagaaaacttaacatatcatgt

 2.08 Intr +  34352  34653  302  1  2   58   80   185 0.923   9.31
aataactatctgaataagaatctggctttaattttaatcccctaggaagaataaagaaaa
cagtttcaaaaaggtgatacttatgatattctgctctagttgacaagtactttataagaa
gaggtaaattttcattctcttcagatcattaaccttattaatatttttgttaatgatcag
GATACCAATGCTGATCCCAAAATTAAGGATTATAAACTATTTAAAATAAAAGGCTCAAAA
ATTGATGGAGAAAAAGCTGAAAAAGGCAATAGAGCTTCAAATGCCAGCTGTCTCCATGAC
AGTAGGACAAGCCACAACAAAATAGTGCCTTCAACAAGCCTCAAAGACTGCAGCAATGTC
AGCGTGGACCACACAAGGAATCCAAGCGTGGCAATTCCCCCACTTACACACAATCTTTCT
GCAGTTGCTCCCAGCATTAATTCTGGAATGGGGACTGAGACTATACCAATTCAGGGTTAC
AG
gtatgaattagtaaaataagatcaaaaaagtgtttaaggacatatttgcaaattgcaagg
gtttgtcaattcatccacattgtttttattctcagaattctggatgctattcattcttgt
caggtagctgtttcaaaagactttttggctgtgtgatgaagattattagcatttgatcaa

 2.09 Intr +  35248  35345   98  1  2  109   71    32 0.547   2.33
catgagggtagtgttaaagaatagaatgtttcaccagatttatgtgcattgtatatttga
gaatagacattacactctggttaaactgcttgttagttggtgctgtgtcatttagttttg
tgcttgaaaaaataattattgctggttctaacttaaaaacatttttttttgtcgttacag
AGTGGATGAGAAAACTAAGAAGTGTTCTATTCCATTTGTTAAACCGAACAGACATTCCCC
ATCAGGCATTTATAACATTAATGTGACCACATTAGTAA
gtaagcagttctcagtagtagaagagcaaacaccagtcagctctagacttttattaaaat
taaatatgatagtgaagtattgagaattttgtttggatacacataaagtgaaaccttaat
tgtgcatatattatcccaacccatcatagtcataaacgtgaaattctgaaagtttaagtt

 2.10 Intr +  39663  39769  107  1  2   63   92    69 0.297   3.81
ttatttaaaatgtatgttagacagaatttaaaaataaaaattcatactaactttacatat
ttaagtatgtaaatacctgttataataagtacatactgaggaacacgtagagaatgtgaa
aaactaaaaactaacaaaatgtctaatattttcactgtgtttatggtcatttctatctag
CTCGAAATTCCAGGCTAACAAAGAAAGAGAGCAAAATTCTTTCAGAATCTCGAATTCCTT
CTCTGGCTGCTATTGACCTGCACACCCCCAGTATTACATTACATCAG
gtacagaaatactctttataggatggacagaactcgggtctctctcttacttactagtaa
agtattttagggagagtttgctcttaagaattgtgcaggtttattggtgggatctataac
attttgcttgcaaatgttgtttgattcattgcacttagtacctttattacatatatattt

 2.11 Intr +  47931  48105  175  2  1   30   30   172 0.007   4.19
gctcgaggaattacaatatacatcactaatttttcgtagtctacattgtaccccttgaaa
taaaaagtacgaattgcccatccatttctccatcatccaggaaagacgttggttttgagg
ttgacatacctataaaggacagtaactaccatggcttccaccgctttggcaaaacctcag
ATGTGTGGTCTTCTGGCCAAATGTCTGCAATTTCATATTGTTGGAGCCTTTATTGTATCC
CTGGGGGTTGCAGCTGTCTGTAAGATTGCTGTGGCTGAACCAAGAAAGAAGACATATGCA
GATTTCTACAGAAATTATGATTCCGTGAAAGATTTGGAGGAGATGGGGAAGGCTG
gtatctttcagaatacaaagtgattttggaatgcaaaggatttctttgggttgaattacc
tagaagtttgtcacttacctgtgttcctgagctatgaaacatgaatatgtggtctaagaa
atagtttctcttgataaataattaacaacaaaaaaagtaggaacattgctaacatattcc

 2.12 Term +  52384  52508  125  2  2   61   43    80 0.135  -1.63
aaagattgtcttaaaaatttgcttttgatacatctaattgaaatctaaggttttcttaaa
ctacatagtacccaccaatgttatcaatatatacgatgtgagaaagcaagtgagatagaa
attaatttttagaaagattttttgtaaaatagttggtggtatatcctcctgtgcttttag
ATGATGCTCTTGCACTTGAGATGACATCTTCTTGCAGCAAGAGTGCTGATATCCCAAGAG
GAGAGATTCATGGTTTTGATCATTTCCTTCTGAACTGCCTGCATTTTCTGAGGAAGGCCT
TCTAG
aagaaggaaagacaaagacttccaaatgtttcaaaggaagattgaacaaatggccctccc
caactgttatcccattacctttcacgtccaccgatgctatttcaagacatatccagtgga
ataacagtgatatggttcttgttacatgaatgtgtatttactgttaggagattgtatatt

Predicted peptide sequence(s):


>CDKL2_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|246_aa
MESRSGRAYATQGARRPPLPQRRCYEGNRIAFCIVFAVLHNRHLYPSRGHHNRLLPLGKA
ERRLLTRTKACGDAGPLRVREQNLGRALGEGAGWLALSQSWLVTTRLGQSEEGRPGALGA
GEKPPPLAAPRPTPSPRGSWSGAGSQAPGVGACRERILTWAVSVSQDFVPMVGDRCELAA
DRGPPASLPASPWTRDCVRRRNHNSAGIASLLGSIFWTCEPYAFHLKFVSKLKTFGSFYA
NGLKKR

>CDKL2_1|GENSCAN_predicted_peptide_2|608_aa
MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK
IDGEKAEKGNRASNASCLHDSRTSHNKIVPSTSLKDCSNVSVDHTRNPSVAIPPLTHNLS
AVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKPNRHSPSGIYNINVTTLVTRNSRLT
KKESKILSESRIPSLAAIDLHTPSITLHQMCGLLAKCLQFHIVGAFIVSLGVAAVCKIAV
AEPRKKTYADFYRNYDSVKDLEEMGKADDALALEMTSSCSKSADIPRGEIHGFDHFLLNC
LHFLRKAF