GENSCAN 1.0	Date run: 16-Jan-104	Time: 07:36:54

Sequence MLH1_1 : 59758 bp : 42.19% C+G : Isochore 1 ( 0 - 43 C+G%)

Parameter matrix: HumanIso.smat

Predicted genes/exons:

Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr..
----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------

 1.02 Intr -    791     31  761  1  2  111   77   879 0.004  79.28
 1.01 Init -   1316   1216  101  2  2   97  -25   157 0.002   5.09
 1.00 Prom -   1595   1556   40                             -10.15

 2.01 Init +   2046   2059   14  2  2   65   87    11 0.001  -1.41
ggctgatgcactttgggcttgacttctgattaccctattgttaaattagtgacccctctt
agtgttttcctgtcctttatttcggaggacgcacttcgaagataccagattttatgggtc
atccttggattttgaagcttataactgtgacaaaaaatgtgaagggaagagatttgaaac
ATGTGGAAGGAAAA
gtgagtgcagactataaacttccaaaaagacaagcccaaaatacacctaaacgttatgtc
agattattttgttaaaatcagttgttagtgacgtccgtacgttaatagaaaaaagaatgc
ttcagtttggagtggtaggtttctagagggatttattgtgaaagtataaactattcaggg

 2.02 Intr +   4332   4422   91  0  1   54  110    96 0.789   7.48
cctctctctcacacaatatgtaaactcatacagtgtatgagcctgtaagacaaaggaaaa
acacgttaatgaggcactattgtttgtatttggagtttgttatcattgcttggctcatat
taaaatatgtacattagagtagttgcagactgataaattattttctgtttgatttgccag
TTTAGATGCAAAATCCACAAGTATTCAAGTGATTGTTAAAGAGGGAGGCCTGAAGTTGAT
TCAGATCCAAGACAATGGCACCGGGATCAGG
gtaagtaaaacctcaaagtagcaggatgtttgtgcgcttcatggaagagtcaggaccttt
ctctgttctggaaactaggcttttgcagatgggattttttcactgaaaaattcaacacca
acaataaatatttattgagtacctattatttgctgggcactgttcaggggatgtgtcagt

 2.03 Intr +   8668   8766   99  0  0   84   99    71 0.990   7.19
agcctgggtgacagagcaagactctgtctcaaaaaaaaaaaaaacaaaaaccaagaaaag
aaaaaaaaactcttctaagaggatttttttttcctggattaaatcaagaaaatgggaatt
caaagagatttggaaaaatgagtaacatgattatttactcatctttttggtatctaacag
AAAGAAGATCTGGATATTGTATGTGAAAGGTTCACTACTAGTAAACTGCAGTCCTTTGAG
GATTTAGCCAGTATTTCTACCTATGGCTTTCGAGGTGAG
gtaagctaaagattcaagaaatgtgtaaaatatcctcctgtgatgacattgtctgtcatt
tgttagtatgtatttctcaacatagataaataaggtttggtaccttttacttgttaaatg
tatgcaaatctgagcaaacttaatgaactttaactttcaaagactgagaattgttcataa

 2.04 Intr +  12114  12187   74  2  2  108   80    35 0.987   1.99
ctacagattgatcatttctttttcaacatgtcatcaaagcaagtgagcaaagtgctcatc
gttgccacatattaatacaaaatggaagcagcagttcagataacctttccctttggtgag
gtgacagtgggtgacccagcagtgagtttttctttcagtctattttcttttcttccttag
GCTTTGGCCAGCATAAGCCATGTGGCTCATGTTACTATTACAACGAAAACAGCTGATGGA
AAGTGTGCATACAG
gtatagtgctgacttcttttactcatatatattcattctgaaatgtattttttgcctagg
tctcagagtaatcctgtctcaacaccagtgttatcttttttggcagagatcttgagtacg
ttttcttttctccttattgataaattgataatcctcaaggatgattattaggtgatactc

 2.05 Intr +  14704  14776   73  1  1   61  107    75 0.975   5.19
aaaaatccaattcaaatgattatggaagtagtggagaaataaacaggaaaatgataaata
attaagataatatataatatggctatattttaatctattgttgatatgattttctctttt
ccccttgggattagtatctatctctctactggatattaatttgttatattttctcattag
AGCAAGTTACTCAGATGGAAAACTGAAAGCCCCTCCTAAACCATGTGCTGGCAATCAAGG
GACCCAGATCACG
gtaagaatggtacatgggagagtaaattgttgaagctttgtttgtataaatattggaata
aaaaataaaattgcttctaagttttcagggtaataataaaatgaatttgcactagttaat
ggaggtcccaagatatcctctaagcaagataaatgactattggcttttgtggcatggcag

 2.06 Intr +  16527  16618   92  2  2   31   92    91 0.760   1.67
atgtcctttaattcttctgttaatgctgtcttatccctggccccagtcagtgcttagaac
tgtgctgttggtaaatataattggattcactatcttaagacctcgcttttgccaggacat
cttgggttttattttcaagtacttctatgaatttacaagaaaaatcaatcttctgttcag
GTGGAGGACCTTTTTTACAACATAGCCACGAGGAGAAAAGCTTTAAAAAATCCAAGTGAA
GAATATGGGAAAATTTTGGAAGTTGTTGGCAG
gtacagtccaaaatctgggagtgggtctctgagatttgtcatcaaagtaatgtgttctag
tgctcatacattgaacagttgctgagctagatggtgaaaagtaaaactagcttacagata
gtttctggtcaaggtttagccaccaattttgcagtttctctcatctccccaggaaagagc

 2.07 Intr +  19533  19575   43  0  1  127  106    15 0.986   4.52
ttctgctggtttatttttctgtgggtaaaatattaataggctgtatggagatatttttct
ttatatgtacctttgtttagattactcaactccactaatttatttaactaaaagggggct
ctgacatctagtgtgtgtttttggcaactcttttcttactcttttgtttttcttttccag
GTATTCAGTACACAATGCAGGCATTAGTTTCTCAGTTAAAAAA
gtaagttcttggtttatgggggatggttttgttttatgaaaagaaaaaaggggattttta
atagtttgctggtggagataaggttatgatgtttcagtctcagccatgagacaataaatc
cttgtgtcttctgctgtttgtttatcagcaaggagagacagtagctgatgttaggacact

 2.08 Intr +  19724  19812   89  1  2   79   88   121 0.997   9.05
acaatgcaggcattagtttctcagttaaaaaagtaagttcttggtttatgggggatggtt
ttgttttatgaaaagaaaaaaggggatttttaatagtttgctggtggagataaggttatg
atgtttcagtctcagccatgagacaataaatccttgtgtcttctgctgtttgtttatcag
CAAGGAGAGACAGTAGCTGATGTTAGGACACTACCCAATGCCTCAACCGTGGACAATATT
CGCTCCATCTTTGGAAATGCTGTTAGTCG
gtatgtcgataacctatataaaaaaatcttttacatttattatcttggtttatcattcca
tcacattattttggaacctttcaagatattatgtgtgttaagagtttgctttagtcaaat
acacaggcttgttttatgcttcagatttgttaatggagttcttatttcacgtaatcaaca

 2.09 Term +  22145  22340  196  2  1   49   42   120 0.547  -0.60
acagacaaatggatggatgaatggacaggcacaggaggacctcaaatggaccaagtcttc
ggggccctcatttcacaaagttagtttatgggaaggaaccttgtgtttttaaattctgat
tcttttgtaatgtttgagttttgagtattttcaaaagcttcagaatctcttttctaatag
AGAACTGATAGAAATTGGATGTGAGGATAAAACCCTAGCCTTCAAAATGAATGGTTACAT
ATCCAATGCAAACTACTCAGTGAAGAAGTGCATCTTCTTACTCTTCATCAACCGTAAGTT
AAAAAGAACCACATGGGAAATCCACTCACAGGAAACACCCACAGGGAATTTTATGGGACC
ATGGAAAAATTTCTGA
tccataggtttgattaaacatggagaaacctcatggcaaagtttggttttattgggaagc
atgtataatttttgtcctaagtctgtgctcagccctcccacatgtgctcattgctggttg
actgttggagtctggttcttacctctaagaggaagcccaggagagggcataaagccagca

 3.02 PlyA -  23946  23941    6                               1.05
 3.01 Sngl -  24700  24233  468  1  0  104   37   588 0.988  51.18
 3.00 Prom -  24825  24786   40                             -10.84

 4.01 Init +  26504  26551   48  1  0   80   58    29 0.544  -1.82
attttttatttgagatggagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcagtggcacaatc
tcatctcattgcaacctccacctcccgcgttcaagcaattctcctgcctcagcctcccga
gtagctgggattacaggtgtgcaccaccacgcccagctaatttttgtatttttagtagag
ATGGATTTTACCATGTTGGCCAGTCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAG
gtgatcctctcactttggcctcccaaagtgttaggattacaggcctcagccactgcaccc
agcctaaagttagttttagattaagtgttttcatgttttcccttgcaaagtaataaactg
gtcaagttatcaccttgttccatctccatattaatcagggtccaaacaggagatagaaac

 4.02 Intr +  27994  28176  183  0  0   60   71   207 0.952  15.26
tgaggcaaagaaagatgatgtaacttacgcaaagctacacagctcttaagtagcagtgcc
aatatttgaacacactcagactcgatcctgaggttttgaccactgtgtcatctggcctca
aatcttctggccaccacatacaccatatgtgggctttttctccccctcccactatctaag
GTAATTGTTCTCTCTTATTTTCCTGACAGTTTAGAAATCAGTCCCCAGAATGTGGATGTT
AATGTGCACCCCACAAAGCATGAAGTTCACTTCCTGCACGAGGAGAGCATCCTGGAGCGG
GTGCAGCAGCACATCGAGAGCAAGCTCCTGGGCTCCAATTCCTCCAGGATGTACTTCACC
CAG
gtcagggcgcttctcatccagctacttctctggggcctttgaaatgtgcccggccagacg
tgagagcccagatttttgcctgttatttaggaactttctttgcaagtattacctggatag
ttttaacattttcttctttgaacctagttataaaggtattgtgctgttgttcctaggctt

 4.03 Intr +  33350  33720  371  1  2   74   80   371 0.696  27.88
ttatacttcaaatttcgggcagaattgcttctataacaatgataattatacctcatacta
gcttctttcttagtactgctccatttggggacctgtatatctatacttcttattctgagt
ctctccactatatatatatatatatatatatatttttttttttttttttttttaatacag
ACTTTGCTACCAGGACTTGCTGGCCCCTCTGGGGAGATGGTTAAATCCACAACAAGTCTG
ACCTCGTCTTCTACTTCTGGAAGTAGTGATAAGGTCTATGCCCACCAGATGGTTCGTACA
GATTCCCGGGAACAGAAGCTTGATGCATTTCTGCAGCCTCTGAGCAAACCCCTGTCCAGT
CAGCCCCAGGCCATTGTCACAGAGGATAAGACAGATATTTCTAGTGGCAGGGCTAGGCAG
CAAGATGAGGAGATGCTTGAACTCCCAGCCCCTGCTGAAGTGGCTGCCAAAAATCAGAGC
TTGGAGGGGGATACAACAAAGGGGACTTCAGAAATGTCAGAGAAGAGAGGACCTACTTCC
AGCAACCCCAG
gtatggccttttgggaaaagtacagcctacctcctttattctgtaataaaactgccttct
aactttggcttttcatgaatcacttgcatcttctctctgcctgacttgccctctggaatg
gtgctggaatggtcctgtggccttgtccactgtctgcctttgaccataacttgaaagtca

 4.04 Intr +  36497  36645  149  2  2  120   83   203 0.988  21.96
aagcagtctaccagagaacagactgatcttgttggccttctgccagcacaggggttcatt
cacagctctgtagaaccagcacagagaagttgcttgctcctccaaaatgcaacccacaaa
atttggctaagtttaaaaacaagaataataatgatctgcacttccttttcttcattgcag
AAAGAGACATCGGGAAGATTCTGATGTGGAAATGGTGGAAGATGATTCCCGAAAGGAAAT
GACTGCAGCTTGTACCCCCCGGAGAAGGATCATTAACCTCACTAGTGTTTTGAGTCTCCA
GGAAGAAATTAATGAGCAGGGACATGAGG
gtacgtaaacgctgtggcctgcctgggatgcatagggcctcaactgccaaggttttggaa
atggagaaagcagtcatgttgtcagagtggccactacagttttgctgggcaagctcctct
tcctttactaacccacaatagcatcagcttaaagacaatttttgattgggagaaaaggga

 4.05 Intr +  47899  48007  109  2  1   91   67   108 0.912   7.42
tgttaaaagattagttatattttattcctcatttgtgttcgttttcaccaggaggctcaa
ttcaggcttctttgcttacttggtgtctctagttctggtgcctggtgctttggtcaatga
agtggggttggtaggattctattacttacctgttttttggttttattttttgttttgcag
TTCTCCGGGAGATGTTGCATAACCACTCCTTCGTGGGCTGTGTGAATCCTCAGTGGGCCT
TGGCACAGCATCAAACCAAGTTATACCTTCTCAACACCACCAAGCTTAG
gtaaatcagctgagtgtgtgaacaagcagagctactacaacaatggtccagggagcacag
gcacaaaagctaaggagagcagcatgaggtagttgggagggcacaggctttggagtcaga
cacatgtggtttcaaatccaagttcgaccatttcccatttatttgactgtagacaagtta

 4.06 Intr +  49981  50044   64  1  1   86  123    32 0.979   4.30
atcccagctctttggaggggtaagagattttgttagactgttaaccagattccacagcca
ggcagaactatttctgtctcatccatgtttcagggattacttctcccattttgtcccaac
tggttgtatctcaagcatgaattcagcttttccttaaagtcacttcatttttattttcag
TGAAGAACTGTTCTACCAGATACTCATTTATGATTTTGCCAATTTTGGTGTTCTCAGGTT
ATCG
gtaagtttagatccttttcacttctgaaatttcaactgatcgtttctgaaaatagtagct
ctccactaatatcttatttgtagtatgttaaatttttctaaaacttctaaggatagttgc
tgtattgtatgatttgcatatggaggtatctataagaagttttatactttttagcaaaat

 4.07 Intr +  55232  55396  165  1  0  101   48   211 0.998  17.64
acaagaggaggaaaggggttttgttgtggattgttcaggcacttcctttggggtatatgg
gggatgagtgttacatttatggtttctcacctgccattctgatagtggattcttgggaat
tcaggcttcatttggatgctccgttaaagcttgctccttcatgttcttgcttcttcctag
GAGCCAGCACCGCTCTTTGACCTTGCCATGCTTGCCTTAGATAGTCCAGAGAGTGGCTGG
ACAGAGGAAGATGGTCCCAAAGAAGGACTTGCTGAATACATTGTTGAGTTTCTGAAGAAG
AAGGCTGAGATGCTTGCAGACTATTTCTCTTTGGAAATTGATGAG
gtgtgacagccattcttatacttctgttgtattcttcaaataaaatttccagccgggtgc
ggtggctcatggctgtaatcccagcactttgggaggctgaggtgggcagataacttgggg
tcaggagttcaaaaccagctggccaacatgatgaaaccccgtctctactaaaaaaataga

 4.08 Intr +  56230  56322   93  0  0   63   78    81 0.839   3.84
ggatgaaaaactcttttttaagtgtttaggtctgcccccagtgcccagcccaatcaagta
acgtggtcacccagagtggcagataggagcacaaggcctgggaaagcactggagaaatgg
gatttgtttaaactatgacagcattatttcttgttcccttgtcctttttcctgcaagcag
GAAGGGAACCTGATTGGATTACCCCTTCTGATTGACAACTATGTGCCCCCTTTGGAGGGA
CTGCCTATCTTCATTCTTCGACTAGCCACTGAG
gtcagtgatcaagcagatactaagcatttcggtacatgcatgtgtgctggagggaaaggg
caaatgaccaccctttgatctggaatgataaagatgataagggtgggatagctgaaggcc
tgctctcatccccactaatattcattcccagcaatattcagcagtcccatttacagtttt

 4.09 Intr +  56617  56730  114  0  0   28   92   136 0.962   7.72
aaggcctgctctcatccccactaatattcattcccagcaatattcagcagtcccatttac
agttttaacgcctaaagtatcacatttcgttttttagctttaagtagtctgtgatctccg
tttagaatgagaatgtttaaattcgtacctattttgaggtattgaatttctttggaccag
GTGAATTGGGACGAAGAAAAGGAATGTTTTGAAAGCCTCAGTAAAGAATGCGCTATGTTC
TATTCCATCCGGAAGCAGTACATATCTGAGGAGTCGACCCTCTCAGGCCAGCAG
gtacagtggtgatgcacactggcaccccaggactaggacaggacctcatacaatctttag
gagatgaaacttgcccatctctaaaatttcgggatttctttgtacccaacaaggttcaaa
cacaacagtcagcttttattcatgatttttacttccatctgctgatgtagaacatacctc

 4.10 Term +  58199  58366  168  1  0   69   36    90 0.628  -1.20
aaaaaatcctcttgtgttcaggcctgtgggatcccctgagaggctagcccacaagatcca
cttcaaaagccctagataacaccaagtctttccagacccagtgcacatcccatcagccag
gacaccagtgtatgttgggatgcaaacagggaggcttatgacatctaatgtgttttccag
AGTGAAGTGCCTGGCTCCATTCCAAACTCCTGGAAGTGGACTGTGGAACACATTGTCTAT
AAAGCCTTGCGCTCACACATTCTGCCTCCTAAACATTTCACAGAAGATGGAAATATCCTG
CAGCTTGCTAACCTGCCTGATCTATACAAAGTCTTTGAGAGGTGTTAA
atatggttatttatgcactgtgggatgtgttcttctttctctgtattccgatacaaagtg
ttgtatcaaagtgtgatatacaaagtgtaccaacataagtgttggtagcacttaagactt
atacttgccttctgatagtattcctttatacacagtggattgattataaataaatagatg

Predicted peptide sequence(s):


>MLH1_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|288_aa
MRFTTVSSSRRITPATNDILAPEEPRKRLDAQRKMWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRY
LVVEPPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGERAALVERLRQGDL
PVASFTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLS
PDITRQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQE
DLLTIINLTHHFSVGALMSAILESLQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIX

>MLH1_1|GENSCAN_predicted_peptide_2|256_aa
MWKENLDAKSTSIQVIVKEGGLKLIQIQDNGTGIRKEDLDIVCERFTTSKLQSFEDLASI
STYGFRGEALASISHVAHVTITTKTADGKCAYRASYSDGKLKAPPKPCAGNQGTQITVED
LFYNIATRRKALKNPSEEYGKILEVVGRYSVHNAGISFSVKKQGETVADVRTLPNASTVD
NIRSIFGNAVSRELIEIGCEDKTLAFKMNGYISNANYSVKKCIFLLFINRKLKRTTWEIH
SQETPTGNFMGPWKNF

>MLH1_1|GENSCAN_predicted_peptide_3|155_aa
MAKSKNHTTHNQSRKWHRNGIKKPRSQRYESLKGVDPKFLRNMHFAKKHNKKGLKKMQAN
NAKAMSARAEAIKALVKPKEVKPKIPKGVSRKLDRLAYIAHPKLGKRARARIAKGLRLCR
PKAKAKDQTKAQAAAPPSVPAQAPKGAQAPTKASE

>MLH1_1|GENSCAN_predicted_peptide_4|487_aa
MDFTMLASLVLNSRPQVIVLSYFPDSLEISPQNVDVNVHPTKHEVHFLHEESILERVQQH
IESKLLGSNSSRMYFTQTLLPGLAGPSGEMVKSTTSLTSSSTSGSSDKVYAHQMVRTDSR
EQKLDAFLQPLSKPLSSQPQAIVTEDKTDISSGRARQQDEEMLELPAPAEVAAKNQSLEG
DTTKGTSEMSEKRGPTSSNPRKRHREDSDVEMVEDDSRKEMTAACTPRRRIINLTSVLSL
QEEINEQGHEVLREMLHNHSFVGCVNPQWALAQHQTKLYLLNTTKLSEELFYQILIYDFA
NFGVLRLSEPAPLFDLAMLALDSPESGWTEEDGPKEGLAEYIVEFLKKKAEMLADYFSLE
IDEEGNLIGLPLLIDNYVPPLEGLPIFILRLATEVNWDEEKECFESLSKECAMFYSIRKQ
YISEESTLSGQQSEVPGSIPNSWKWTVEHIVYKALRSHILPPKHFTEDGNILQLANLPDL
YKVFERC