GENSCAN 1.0	Date run: 14-Jan-104	Time: 16:50:55

Sequence VANGL1_1 : 42852 bp : 45.71% C+G : Isochore 2 (43 - 51 C+G%)

Parameter matrix: HumanIso.smat

Predicted genes/exons:

Gn.Ex Type S .Begin ...End .Len Fr Ph I/Ac Do/T CodRg P.... Tscr..
----- ---- - ------ ------ ---- -- -- ---- ---- ----- ----- ------

 1.01 Init +   4043   4143  101  1  2   58   78    58 0.309   1.53
aggcatgagagcaggccccaggcccagctaagggtattttgtccaaggagtgttcctgtg
aaggctgccctgctcagaggtttgttgggaacttgaatggaagggtaggaggcgggttgg
ggttggagggggaccatgctctttggtaattttagtcagagtccaactcagggaggaata
ATGAAATGCACCAAACTTGATATGCCTGATGACACCATGATCATCTTAGAAGACTGGCCA
GGTTCCAAGCAGATGACAAGTGACTGTTTTCTAACAAAGAG
gtcagtggcctggttttgcgatgcctgcagtctccagagggtgtccagttaacttgctgg
gagaatggtgtggactcctgctgaccccgcctaacttttgtcattgtggtgtggatgagg
gaagcctggtattgacaagggaattggtagggctaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatt

 1.02 Intr +   9440   9572  133  2  1  102  110    11 0.937   5.35
gtgtaccccttgaagtgtggtgaagatgggtgggttttgatgctctgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtagaatttccctaaattcaaaatgatacttacatttt
gataaacccagagagttaattaacatggcataaatgtgctagctcattgttgtttttcag
GGAAAGAACTAGAGAGAGACACAAGTCACCCCGGAATAAAGACGGCAGAGGGTCAGAAAA
GTCTGTCACCATTCAACCTCCCACTGGAGAGCCCCTGTTGGGAAATGATTCTACTCGGAC
AGAGGAAGTTCAG
gtaaggatcaaaggtggtctgtaagcacactgccacttggccaagactcctgtctgtaaa
tgttttccttaggttctcttggatttttgtctttatttttctagcatgctaattagttta
tctatgtcccatggtctcttgttggtctaaggacagcctgtcctgccctttggtagcgtg

 1.03 Intr +  13460  14067  608  1  2  110   94   696 0.591  63.65
aatttcaatgaaaatcgtttgagttaagaagttctaatatttaaagagttaagctttcat
tttctggaagcctttgtgaatagggctgggtagatgcagcgggccctgcatgttcactgc
cctttgtagcttttacaaatgacctgtgtcatgtcatcctcactgtcttctccccaccag
GATGACAACTGGGGAGAGACCACCACGGCCATCACAGGCACCTCGGAGCACAGCATATCC
CAAGAGGACATTGCCAGGATCAGCAAGGACATGGAGGACAGCGTGGGGCTGGATTGCAAA
CGCTACCTGGGCCTCACCGTCGCCTCTTTTCTTGGACTTCTAGTTTTCCTCACCCCTATT
GCCTTCATCCTTTTACCTCCGATCCTGTGGAGGGATGAGCTGGAGCCTTGTGGCACAATT
TGTGAGGGGCTCTTTATCTCCATGGCATTCAAACTCCTCATTCTGCTCATAGGGACCTGG
GCACTTTTTTTCCGCAAGCGGAGAGCTGACATGCCACGGGTGTTTGTGTTTCGTGCCCTT
TTGTTGGTCCTCATCTTTCTCTTTGTGGTTTCCTATTGGCTTTTTTACGGGGTCCGCATT
TTGGACTCTCGGGACCGGAATTACCAGGGCATTGTGCAATATGCAGTCTCCCTTGTGGAT
GCCCTCCTCTTCATCCATTACCTGGCCATCGTCCTGCTGGAGCTCAGGCAGCTGCAGCCC
ATGTTCACGCTGCAGGTGGTCCGCTCCACCGATGGCGAGTCCCGCTTCTACAGCCTGGGA
CACCTGAG
gtaagaggcaacatccaggaggcagaaaggatggctgatgtcttgctgggagacagctgc
tctgtagcacgtgaggggtggtgacagatgccaagagctaggaccagagtctgactcttt
tctggtttggggaggagatgcgagggtggggagggtgtccatgttcattgagtttctgga

 1.04 Intr +  32163  32296  134  0  2   73   80   132 0.592  11.19
ttagtttcagctttaagttctcatcctggagaccagaagtgtggtggaacccagtggact
tctgtatgagattatctttgatgttgtgttcctttacctgactccaaaagaggatttttc
gtttaggacctgcttcttcagtgaaaaagctttgcattaattttgttctttttttctcag
TATCCAGCGAGCAGCATTGGTGGTCCTAGAAAATTACTACAAAGATTTCACCATCTATAA
CCCAAACCTCCTAACAGCCTCCAAATTCCGAGCAGCCAAGCATATGGCCGGGCTGAAAGT
CTACAATGTAGATG
gtatgtgccttgaaagggtgtccgtggtgctcacaggggcacagttgggtgactatttaa
gattcatggtacgtttggttcgacttcttctctgggcctacctttatggtacattcttgt
ttcagaacaatttctcttttttatgtaggcagacacatgtttagaggaatgttgatttac

 1.05 Intr +  33743  33875  133  0  1   89   69   195 0.999  17.40
gacatagtgaatgtggagccggggcacagttcaccctcctgggaagtgacctttaggatt
tgtgtgtgtgtgttccatagggggtgggtagacaacactgacagattgggtactagtttt
ctgctctgtttcccaccctcgtggtattaacactattctttcactgtcctttccccaaag
GCCCCAGTAACAATGCCACTGGCCAGTCCCGGGCCATGATTGCTGCAGCTGCTCGGCGCA
GGGACTCAAGCCACAACGAGTTGTATTATGAAGAGGCCGAACATGAACGGCGAGTAAAGA
AGCGGAAAGCAAG
gtatactgccctcctgatgccagtaccctcttacagacttttaaatttttattttattta
tttatttatttatttatttagagacagaatctcactctgttgcccaggctggagtgcagt
ggcaagatcttggctcactgtcacctctgcctcccaggttccagtgattctcatgcctca

 1.06 Intr +  35092  35326  235  1  1   51   91   324 0.951  26.69
gcctttctttctcccttcctccctctccactctctgagggacagctaaggatgcaagcag
cgtgattgggccttgggtatgttggcaggttgggccgcagcagggtagacaagcgtcatt
ctgttctcacaccctgtggcaggcaccatcctgattacttagtgttgcatcaccttctag
GCTGGTGGTTGCAGTGGAAGAGGCCTTCATCCACATTCAGCGTCTCCAGGCTGAGGAGCA
GCAGAAAGCCCCAGGGGAGGTGATGGACCCTAGGGAGGCCGCCCAGGCCATTTTCCCCTC
CATGGCCAGGGCTCTCCAGAAGTACCTGCGCATCACCCGGCAGCAGAACTACCACAGCAT
GGAGAGCATCCTGCAGCACCTGGCCTTCTGCATCACCAACGGCATGACCCCCAAG
gtgcgctgctccgggcgggctctgccaccgtcatcctggcttgtcactgagcttggccag
ttgaattatagcgtgttactagaagtgataaaatcgaaaggcatctctaaaactcaagta
ataagaattagtgattctcacttattttatgttatgttagtacaattgtttttttaaatg

 1.07 Term +  40918  41178  261  0  0  122   42   167 0.959  11.03
ccccagtaatgactcagttgtgagggtctgatgggaattgagtgtgatgagctgggctct
ggtctaagctggtttatttggaaaaagttctttatagatgtgagagtggatagccgcctg
gcagtactgcccttaaaacaggctgtttcttccctaatggcctttctcctctgcttccag
GCCTTCCTAGAACGGTACCTCAGTGCGGGCCCCACCCTGCAATATGACAAGGACCGCTGG
CTCTCTACACAGTGGAGGCTTGTCAGTGATGAGGCTGTGACTAATGGATTACGGGATGGA
ATTGTGTTCGTCCTTAAGTGCTTGGACTTCAGCCTCGTAGTCAATGTGAAGAAAATTCCA
TTCATCATACTCTCTGAAGAGTTCATAGACCCCAAATCTCACAAATTTGTCCTTCGCTTA
CAGTCTGAGACATCCGTTTAA
aagttctatatttgtggctttattaaaaaaaaaagaaaaatatatagagagatatatatc
tatgccagaggggtgtcttttttaaaaattcttcttcattgctgactgaaactggcagat
gattgaccagtatcctttgaccatctgcactttatttggaaggaagcaggggctgtccac

Predicted peptide sequence(s):


>VANGL1_1|GENSCAN_predicted_peptide_1|534_aa
MKCTKLDMPDDTMIILEDWPGSKQMTSDCFLTKRERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQP
PTGEPLLGNDSTRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRY
LGLTVASFLGLLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWAL
FFRKRRADMPRVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDAL
LFIHYLAIVLLELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIY
NPNLLTASKFRAAKHMAGLKVYNVDGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEH
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